RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 HSPB9Q9BQS6 159 aa10.92□□□□□ -0.66
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PRAME-209ENST00000439106 PLSCR3Q9NRY6 295 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 AK3Q9UIJ7 227 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa10.91□□□□□ -0.66
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PRAME-209ENST00000439106 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
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PRAME-209ENST00000439106 OR10A3P58181 314 aa10.91□□□□□ -0.66
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PRAME-209ENST00000439106 IFI27L2Q9H2X8 130 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 ACOT13Q9NPJ3 140 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa10.9□□□□□ -0.66
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PRAME-209ENST00000439106 LANCL1O43813 399 aa10.9□□□□□ -0.66
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PRAME-209ENST00000439106 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 OR2W3Q7Z3T1 314 aa10.9□□□□□ -0.66
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PRAME-209ENST00000439106 CHPT1Q8WUD6 406 aa10.9□□□□□ -0.66
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PRAME-209ENST00000439106 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 OR1A1Q9P1Q5 309 aa10.9□□□□□ -0.66
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PRAME-209ENST00000439106 YPEL2Q96QA6 119 aa10.89□□□□□ -0.67
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PRAME-209ENST00000439106 HLA-DRB3P79483 266 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 C2orf76Q3KRA6 126 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 PLAC9Q5JTB6 97 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 STEAP3Q658P3 488 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 ABHD14BQ96IU4 210 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 NDUFB11Q9NX14 153 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 STEAP1Q9UHE8 339 aa10.88□□□□□ -0.67
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PRAME-209ENST00000439106 ACTBP60709 375 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 SLC35B1P78383 322 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 DEFB136Q30KP8 78 aa10.87□□□□□ -0.67
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PRAME-209ENST00000439106 NR2C2APQ86WQ0 139 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 LINC00482Q8N8I6 264 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 WFDC9Q8NEX5 89 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 ZNF251Q9BRH9 671 aa10.87□□□□□ -0.67
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