RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGHV3-7P01780 117 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CD1BP29016 333 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR10A3P58181 314 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EBI3Q14213 229 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HERPUD1Q15011 391 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
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TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRR18Q8N4B5 295 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CFHR4Q92496 578 aa6.51□□□□□ -1.37
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TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF702PQ9H963 129 aa6.51□□□□□ -1.37
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TTC28-AS1-216ENST00000437713 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANK2Q01484 3957 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A1W2PPE3 182 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A1W2PPI3 338 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSD17B6O14756 317 aa6.5□□□□□ -1.37
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TTC28-AS1-216ENST00000437713 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZBTB25P24278 435 aa6.5□□□□□ -1.37
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TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF134P52741 427 aa6.5□□□□□ -1.37
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TTC28-AS1-216ENST00000437713 HES1Q14469 280 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIR2DS1Q14954 304 aa6.5□□□□□ -1.37
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TTC28-AS1-216ENST00000437713 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.5□□□□□ -1.37
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TTC28-AS1-216ENST00000437713 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.5□□□□□ -1.37
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TTC28-AS1-216ENST00000437713 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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TTC28-AS1-216ENST00000437713 ETV7Q9Y603 341 aa6.5□□□□□ -1.37
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TTC28-AS1-216ENST00000437713 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PHF21AQ96BD5 680 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 S1PR3Q99500 378 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.49□□□□□ -1.37
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