RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF17P17021 662 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 MAGP20916 626 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 GABRA4P48169 554 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CD164Q04900 197 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RAB31Q13636 194 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 C6orf99Q4VX62 202 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 IDNKQ5T6J7 187 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PCP2Q8IVA1 136 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR4K17Q8NGC6 315 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR5AK3PQ8NH89 298 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 DCAKDQ8WVC6 231 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PHYHIPLQ96FC7 376 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TMED9Q9BVK6 235 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ABCB9Q9NP78 766 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 DOCK4Q8N1I0 1966 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CHD5Q8TDI0 1954 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 MED13LQ71F56 2210 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TXNDC9O14530 226 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 MFSD11O43934 449 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PSMB2P49721 201 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ERFP50548 548 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RAP1AP62834 184 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PLGLB1Q02325 96 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PDK2Q15119 407 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 KDM4DQ6B0I6 523 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OPN5Q6U736 354 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 MDP1Q86V88 176 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 LYG1Q8N1E2 194 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 GAPTQ8N292 157 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 SPICQ8N5J4 248 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TRIB3Q96RU7 358 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ANKRD36A6QL64 1941 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 A0A0A6YYH2 397 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 A0A1B0GX12 115 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 A6NJ64 397 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 IGKV1D-16P01601 117 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 IGKV3-15P01624 115 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 GABRA1P14867 456 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 AQP5P55064 265 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 WNT4P56705 351 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM249Q2WGJ8 235 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM156Q8N614 296 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 Q8N976 141 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR2AE1Q8NHA4 323 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RILPQ96NA2 401 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR2A5Q96R48 311 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 METTL26Q96S19 204 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CCL19Q99731 98 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 HEY1Q9Y5J3 304 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 GOLGA6L10A6NI86 522 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 UBDO15205 165 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 NDUFS5O43920 106 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 REM1O75628 298 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 KLHL2O95198 593 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 KRTAP5-9P26371 169 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CCR6P51684 374 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR10A3P58181 314 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PITPNAQ00169 270 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 IHHQ14623 411 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF79Q15937 498 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM205Q6UW68 189 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 UGT2A3Q6UWM9 527 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 FUNDC1Q8IVP5 155 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 C15orf40Q8WUR7 153 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms