RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 DLK1P80370 383 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 DEFB123Q8N688 67 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 RSG1Q9BU20 258 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 BCL2L14Q9BZR8 327 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 AP4M1O00189 453 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 WDR1O75083 606 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 SLC35E3Q7Z769 313 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 DRAM1Q8N682 238 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM178AQ8NBL3 297 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 UBALD1Q8TB05 177 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 OR14J1Q9UGF5 321 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM210A6NLX4 147 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 IQCF6A8MYZ5 107 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 FABP1P07148 127 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 SELEP16581 610 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 DHRS13Q6UX07 377 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 SLC25A40Q8TBP6 338 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 SIRT7Q9NRC8 400 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 RPRMQ9NS64 109 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 FAM90A26D6RGX4 464 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF806P0C7X5 589 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 ERVS71-1P61550 626 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 ARL16Q0P5N6 197 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 MBD3L1Q8WWY6 194 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 KCNIP1Q9NZI2 227 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 LILRB2Q8N423 598 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 GNG13Q9P2W3 67 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD13-201ENST00000392539 CXorf65A6NEN9 183 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF727A8MUV8 499 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV1-2P23083 117 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 SERF2P84101 59 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 HES3Q5TGS1 186 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 HAPLN4Q86UW8 402 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 HAND1O96004 215 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 ALKBH6Q3KRA9 238 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF787Q6DD87 383 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 ZBTB34Q8NCN2 500 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 PPIHO43447 177 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 GRPP07492 148 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 NQO2P16083 231 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 SLC16A13Q7RTY0 426 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 MMP24Q9Y5R2 645 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 KNTC1P50748 2209 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 RPS10P46783 165 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 PSG7Q13046 419 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 FGFRL1Q8N441 504 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 B4DEV8 164 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF645Q8N7E2 425 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 HES4Q9HCC6 221 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00587B1AMM8 73 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 BCL2P10415 239 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 SPANXN5Q5MJ07 72 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 OR51M1Q9H341 326 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 VSIRQ9H7M9 311 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 GLIPR1P48060 266 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 ELOBQ15370 118 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 LYZL6O75951 148 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF726P1Q15940 193 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 GALMQ96C23 342 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 NIT2Q9NQR4 276 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 FAM186AA6NE01 2351 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM41BQ5BJD5 291 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 LCN15Q6UWW0 184 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 OR4C12Q96R67 309 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 ZFP92A6NM28 416 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 S100PP25815 95 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 RAB11AP62491 216 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 SLC35E4Q6ICL7 350 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 OR1L1Q8NH94 360 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 Q8WTZ3 238 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF665Q9H7R5 613 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 OBP2BQ9NPH6 170 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 CLCF1Q9UBD9 225 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 PSPNO60542 156 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 OR3A1P47881 315 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 SLC38A11Q08AI6 406 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD13-201ENST00000392539 MSMO1Q15800 293 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms