RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.31□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.31□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.31□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 UEVLDQ8IX04 471 aa7.31□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.31□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.31□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 SLC25A22Q9H936 323 aa7.31□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 GP6Q9HCN6 339 aa7.31□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.3□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 STPG3Q8N7X2 389 aa7.3□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 CT55Q8WUE5 264 aa7.3□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.29□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.29□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM45BQ96B21 275 aa7.29□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 ST20Q9HBF5 79 aa7.29□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 SPACA6W5XKT8 324 aa7.29□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 hDV102S1A0JD36 115 aa7.28□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF141Q15928 474 aa7.28□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 LIME1Q9H400 295 aa7.28□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 SNAI2O43623 268 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 HSBP1O75506 76 aa7.28□□□□□ -1.24
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NHLRC3-201ENST00000379599 CPMP14384 443 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 IGFBP7Q16270 282 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.28□□□□□ -1.24
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