RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 SPNP16150 400 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 AKR1C4P17516 323 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 MIPP30301 263 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SLCO1A2P46721 670 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 RANP62826 216 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 GTF2BQ00403 316 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 AESQ08117 197 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 ALX1Q15699 326 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 CST9Q5W186 159 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 XKRXQ6PP77 449 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC25A45Q8N413 288 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 ZDHHC22Q8N966 263 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5B17Q8NGF7 314 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 CMTM2Q8TAZ6 248 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC37A2Q8TED4 501 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 C16orf78Q8WTQ4 265 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TESCQ96BS2 214 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 EBPLQ9BY08 206 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP1LC3AQ9H492 121 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 PARP11Q9NR21 331 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM38BQ9NVV0 291 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 INSIG2Q9Y5U4 225 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SNX10Q9Y5X0 201 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 NOS1P29475 1434 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SSH2Q76I76 1423 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF407Q9C0G0 2248 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 KMT2EQ8IZD2 1858 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 METTL15A6NJ78 407 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 CD300LBA8K4G0 201 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TCF21O43680 179 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 DHRS3O75911 302 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4E1P0C645 316 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 MYL12AP19105 171 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 PRTN3P24158 256 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS12P25398 132 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 ELK4P28324 431 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL12P30050 165 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TGFBR2P37173 567 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 CCL23P55773 120 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2F1Q13607 317 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST3H3Q16695 136 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 GUK1Q16774 197 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 CLEC20AQ6ZU45 233 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 VN1R4Q7Z5H5 301 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 PRNTQ86SH4 94 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 GALNT10Q86SR1 603 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF555Q8NEP9 628 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TAMM41Q96BW9 452 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC25A31Q9H0C2 315 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TLNRD1Q9H1K6 362 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXL15Q9H469 300 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 DMAC2Q9NW81 257 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 NAV1Q8NEY1 1877 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 FLT4P35916 1363 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 ARGFXA6NJG6 315 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLL5B9A064 214 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF878C9JN71 531 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BQ85 93 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 J3QRE1 110 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNK1O00180 336 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 FADS1O60427 444 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2A4O95047 310 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 CXorf1O96002 111 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPINA1P01009 418 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 IFNA14P01570 189 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 ALOX5APP20292 161 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 MSNP26038 577 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC6A1P30531 599 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 AGTR1P30556 359 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 PYCR1P32322 319 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 RCVRNP35243 200 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 OMPP47874 163 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT2P50583 147 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 H2BFSP57053 126 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SMAGPQ0VAQ4 97 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TMED2Q15363 201 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF141Q15928 474 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC121Q6ZUS5 278 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM144Q7Z5S9 345 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 LYG2Q86SG7 212 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TAC4Q86UU9 113 aa1.62□□□□□ -2.15
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