RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 PI4KAP42356 2102 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC2LP0C7M8 214 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 PAX1P15863 534 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 FZD5Q13467 585 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 RAB32Q13637 225 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 ATP23Q9Y6H3 246 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 LDB3O75112 727 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 DYNLT3P51808 116 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 FGF12P61328 243 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 WDR38Q5JTN6 314 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 SMIM30A4D0T7 59 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 DLX1P56177 255 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 HES1Q14469 280 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 TP53INP2Q8IXH6 220 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 ATOH7Q8N100 152 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 GBGT1Q8N5D6 347 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 RARRES2Q99969 163 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP4.3□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 P2RY6Q15077 328 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 HES3Q5TGS1 186 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 FAM27BQ5VT28 67 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 SFTA2Q6UW10 78 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 OR51E1Q8TCB6 317 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 ASPDHA6ND91 283 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 C1QAP02745 245 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 BEX5Q5H9J7 111 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 Q8WTZ3 238 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 C5orf30Q96GV9 206 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 NNATQ16517 81 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZS49 121 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 OR11H7Q8NGC8 314 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 RAB1CQ92928 201 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 RSRP1Q9BUV0 290 aa4.29□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 LINC00470Q9BZP3 86 aa4.29□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 Q1RN00 199 aa4.29□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 FOXL1Q12952 345 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.29□□□□□ -1.72
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