RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRGPRFQ96AM1 343 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM133Q9H2Q1 129 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNS2Q9ULS6 477 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNG10P50151 68 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB7AP51149 207 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 LY6G6FQ5SQ64 297 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMED4Q7Z7H5 227 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC01356Q8N9X3 169 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 FLVCR2Q9UPI3 526 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSG11Q9UQ72 335 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 VSIG4Q9Y279 399 aa22.48■■□□□ 1.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV1-13P0DP09 117 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q3ZCU0 254 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCA11PQ4W5N1 156 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 UPRTQ96BW1 309 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf159Q96HA4 380 aa22.47■■□□□ 1.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR132Q9UNW8 380 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGB1BP1O14713 200 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB25P57735 213 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF150Q9ULK6 438 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 INSIG2Q9Y5U4 225 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV20A0A0B4J274 112 aa22.46■■□□□ 1.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 S100GP29377 79 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABHD12Q8N2K0 398 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q8N7P7 452 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR13D1Q8NGV5 346 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2D2Q9H210 308 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF221Q9UK13 617 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A087X0M5 115 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GX30 115 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOR1AO14656 332 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSD17B6O14756 317 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A5O76082 557 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOX4O94842 621 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHFRP00374 187 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCAF12L2Q5VW00 463 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CMTM1Q8IZ96 169 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR9G1Q8NH87 305 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 RSRP1Q9BUV0 290 aa22.45■■□□□ 1.18
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CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PPE3 182 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 PEX14O75381 377 aa22.44■■□□□ 1.18
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GZMKP49863 264 aa22.44■■□□□ 1.18
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC7AQ9BXN2 247 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCL28Q9NRJ3 127 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR31O00270 319 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 COX7A1P24310 79 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR12P47775 334 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R31P59538 309 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM249Q2WGJ8 235 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CT45A1Q5HYN5 189 aa22.43■■□□□ 1.18
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CTDNEP1-201ENST00000318988 VMO1Q7Z5L0 202 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF645Q8N7E2 425 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF439Q8NDP4 499 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CT45A3Q8NHU0 189 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM186Q96B77 213 aa22.43■■□□□ 1.18
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C5orf66Q9H5L9 145 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa22.42■■□□□ 1.18
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GATA3P23771 443 aa22.42■■□□□ 1.18
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF134P52741 427 aa22.42■■□□□ 1.18
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 C8orf31Q8N9H6 132 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10X1Q8NGY0 326 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKR1E2Q96JD6 320 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 BEX2Q9BXY8 128 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 GHITMQ9H3K2 345 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 BEX1Q9HBH7 125 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIF1ANQ9NWT6 349 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITPR2Q14571 2701 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 J3QR06 171 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC31A2O15432 143 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAX8Q06710 450 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCR3LG1Q68D85 454 aa22.41■■□□□ 1.18
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