RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264244.7

TIMMDC1-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMMDC1, Length 1,271 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR10K1Q8NGX5 313 aa9.41□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM106AQ96A25 262 aa9.41□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 MS4A10Q96PG2 267 aa9.41□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF251Q9BRH9 671 aa9.41□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.41□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 CST11Q9H112 138 aa9.41□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.41□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 A3GALT2U3KPV4 340 aa9.41□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A087WXM4 84 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 NDUFA3O95167 84 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 EPHA2P29317 976 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 TPPP2P59282 170 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 CX3CL1P78423 397 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF85Q03923 595 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF691Q5VV52 312 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 STEAP3Q658P3 488 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 LCN12Q6JVE5 192 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 CANT1Q8WVQ1 401 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 CNBD2Q96M20 576 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 IFT22Q9H7X7 185 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 C8orf4Q9NR00 106 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-201ENST00000264244 SLC22A1O15245 554 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 SULT1B1O43704 296 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 MT-ND4P03905 459 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZP3P21754 424 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 FASP25445 335 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 DAPP51397 102 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 ACTBL2Q562R1 376 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 C12orf73Q69YU5 71 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 FDX2Q6P4F2 183 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q8N402 240 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 GNG12Q9UBI6 72 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 CXorf65A6NEN9 183 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZAR1LA6NP61 321 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 GABRPO00591 440 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 FCN1O00602 326 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 DEDDO75618 318 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 CNIH1O95406 144 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 RSU1Q15404 277 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 ASCL4Q6XD76 172 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF497Q6ZNH5 498 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 AMIGO2Q86SJ2 522 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 ODF3L1Q8IXM7 274 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 NUPR2A6NF83 97 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 AIPO00170 330 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 RGS13O14921 159 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 NOL3O60936 208 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 HTR3BO95264 441 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 CSN3P07498 182 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 ATP6V1E1P36543 226 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 CCR9P51686 369 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 SYNJ2BPP57105 145 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 CD81P60033 236 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 PMS2P11Q13670 270 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRIM16LQ309B1 348 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 NHLRC3Q5JS37 347 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 PPP1R27Q86WC6 154 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRR18Q8N4B5 295 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 DEFB125Q8N687 156 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 FBXL15Q9H469 300 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 RNF150Q9ULK6 438 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 GAB2Q9UQC2 676 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.37□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.36□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPINT2O43291 252 aa9.36□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 CDRT1O95170 752 aa9.36□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 HBZP02008 142 aa9.36□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRGV3P03979 118 aa9.36□□□□□ -0.91
TIMMDC1-201ENST00000264244 HTR1AP08908 422 aa9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms