RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1451Q8VFX5 310 aa18.77■□□□□ 0.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr156Q8VGA9 318 aa18.77■□□□□ 0.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abhd12Q99LR1 398 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smurf1Q9CUN6 731 aa18.77■□□□□ 0.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ube2fQ9CY34 185 aa18.77■□□□□ 0.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AcanQ61282 2132 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr373E9Q4J3 314 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1348F6VB59 318 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r82G3UWA2 865 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hoxb6P09023 224 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rps11P62281 158 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igfbp5Q07079 271 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SbsponQ3UPR9 264 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm12258Q5NC63 627 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 5730522E02RikQ5SP45 163 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr874Q7TRE6 310 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr372Q7TRY2 314 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcgf1Q8R023 259 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tex12Q9CR81 123 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ranbp3Q9CT10 491 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cmtm6Q9CZ69 183 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dimt1Q9D0D4 313 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam122cQ9D5J5 180 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 2200002D01RikQ9D809 114 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbmxl2Q9DAE2 385 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chrm2Q9ERZ4 466 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tas2r105Q9JKT4 300 aa18.76■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm42543A0A0G2JET4 117 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1107A2AVB8 312 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr248E9Q1L6 309 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rhox2hK7N6P1 191 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Onecut1O08755 465 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lsm2O35900 95 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RcvrnP34057 202 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arf6P62331 175 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Defb26Q30KN7 186 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm773Q3TML4 206 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r223Q5SSA0 361 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmprss13Q5U405 543 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Med22Q62276 200 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scgb1c1Q7M742 95 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr304Q7TS03 333 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Actbl2Q8BFZ3 376 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r19Q8R2C7 308 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 V1ra11Q8R2E6 318 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc58Q8R3Q6 144 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccm2lQ8VCC6 481 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Alg12Q8VDB2 486 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rcc1Q8VE37 421 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr57Q8VGU7 319 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ift27Q9D0P8 186 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnip1Q9JJ57 227 aa18.75■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 D930048N14RikA2AA67 225 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm11009F7CWA7 138 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GzmbP04187 247 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HbzP06467 142 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hes3Q61657 175 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ssxb2Q8C5Z3 165 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 St7lQ8K4P7 559 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr836Q8VFJ3 317 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1226Q8VGM5 310 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 As3mtQ91WU5 376 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Srd5a2Q99N99 254 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem52Q9D702 196 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mmp1bQ9EPL6 463 aa18.74■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igkv4-50A0A0B4J1J0 117 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IsxA1A546 240 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf385cA2A5E6 429 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm4950D3YUM8 205 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr914E9PW59 316 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr521E9Q519 321 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Psg20E9Q9B4 475 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ear3O35290 156 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prss39O70169 367 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MbpP04370 250 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ShbgP97497 403 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Apoc2Q05020 97 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LvrnQ2KHK3 559 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Neil2Q6R2P8 329 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CdsnQ7TPC1 561 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prss45Q8K4I7 317 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1250Q8VGM3 314 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr575Q8VH16 318 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q91V76 315 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q9CX63 252 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gfod2Q9CYH5 385 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmbim6Q9D2C7 237 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plpp6Q9D4F2 292 aa18.73■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1490A0A1L1SVH0 321 aa18.72■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddi2A2ADY9 399 aa18.72■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sac3d1A6H687 427 aa18.72■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GdnfP48540 211 aa18.72■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gabrb1P50571 474 aa18.72■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rab3ipQ68EF0 428 aa18.72■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1252Q7TQZ2 314 aa18.72■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr429Q7TRW1 312 aa18.72■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Swi5Q8K3D3 89 aa18.72■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abhd17cQ8VCV1 320 aa18.72■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrpl15Q9CPR5 295 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dcun1d5Q9CXV9 237 aa18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.3 ms