RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 C10orf99Q6UWK7 81 aa23.02■■□□□ 1.28
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SEMA3B-215ENST00000621029 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa23.02■■□□□ 1.28
SEMA3B-215ENST00000621029 OR6M1Q8NGM8 313 aa23.02■■□□□ 1.28
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2T10Q8NGZ9 312 aa23.02■■□□□ 1.28
SEMA3B-215ENST00000621029 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SEMA3B-215ENST00000621029 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SEMA3B-215ENST00000621029 FAAP24Q9BTP7 215 aa23.02■■□□□ 1.28
SEMA3B-215ENST00000621029 ISYNA1Q9NPH2 558 aa23.02■■□□□ 1.28
SEMA3B-215ENST00000621029 PSMB11A5LHX3 300 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 SERPINE3A8MV23 424 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC22A1O15245 554 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 ARL6IP5O75915 188 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 CHATP28329 748 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 CT45A1Q5HYN5 189 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 PRSS48Q7RTY5 328 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 C6orf201Q7Z4U5 140 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 OR52L2PQ8NGH6 319 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 CT45A3Q8NHU0 189 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 SULT4A1Q9BR01 284 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 BPNT1O95861 308 aa23■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF134P52741 427 aa23■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 P2RY14Q15391 338 aa23■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 IZUMO1Q8IYV9 350 aa23■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF439Q8NDP4 499 aa23■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa23■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 MGLLQ99685 303 aa23■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 NICN1Q9BSH3 213 aa23■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 TXNL1O43396 289 aa22.99■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 CPEP16870 476 aa22.99■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 UNC119Q13432 240 aa22.99■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM91Q6ZNR0 172 aa22.99■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 C5orf24Q7Z6I8 188 aa22.99■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC35E3Q7Z769 313 aa22.99■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 SETD6Q8TBK2 473 aa22.99■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 ABRACLQ9P1F3 81 aa22.99■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 BLOC1S6Q9UL45 172 aa22.99■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 PF4P02776 101 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 ARSBP15848 533 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 CD1BP29016 333 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 EBI3Q14213 229 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 GNMTQ14749 295 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 BEAN1Q3B7T3 259 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 MORN2Q502X0 79 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 SAMD5Q5TGI4 173 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF554Q86TJ5 538 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF329Q86UD4 541 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 GALMQ96C23 342 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 LINC00527Q9UJ94 153 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 MOSP00540 346 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 CD33P20138 364 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 CALRP27797 417 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 RAB11BQ15907 218 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 OXLD1Q5BKU9 147 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 STEAP3Q658P3 488 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 FOXRED2Q8IWF2 684 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 CHPT1Q8WUD6 406 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 TM2D1Q9BX74 207 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 JPT1Q9UK76 154 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC42Q9Y546 428 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM14DPA8MWL7 114 aa22.96■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 IL1F10Q8WWZ1 152 aa22.96■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa22.96■■□□□ 1.27
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC17A2O00624 439 aa22.95■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 RGS11O94810 467 aa22.95■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC35B1P78383 322 aa22.95■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 QRFPP83859 136 aa22.95■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 FABP5Q01469 135 aa22.95■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 RASL11BQ9BPW5 248 aa22.95■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 ACOT13Q9NPJ3 140 aa22.95■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 CD37P11049 281 aa22.94■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF137PP52743 207 aa22.94■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 HTD2P86397 168 aa22.94■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2W3Q7Z3T1 314 aa22.94■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 Q8N6K4 173 aa22.94■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 GFI1Q99684 422 aa22.94■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 LANCL1O43813 399 aa22.93■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHG2P01859 326 aa22.93■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF367Q7RTV3 350 aa22.93■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2AK2Q8NG84 335 aa22.93■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 LPAR5Q9H1C0 372 aa22.93■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 STEAP1Q9UHE8 339 aa22.93■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 RAB26Q9ULW5 256 aa22.93■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A0A6YYD4 124 aa22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 SOCS1O15524 211 aa22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 PLXNB1O43157 2135 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms