RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB3CQ96E17 227 aa9.15□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 MMP28Q9H239 520 aa9.15□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.15□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 DPM3Q9P2X0 92 aa9.15□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.15□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.15□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1W2PPE3 182 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 VGLL3A8MV65 326 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 LY6LH3BQJ8 138 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 MFNGO00587 321 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SPINT2O43291 252 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 GNB3P16520 340 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 GNG10P50151 68 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 PRRX1P54821 245 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SCAND1P57086 179 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 HMGN3Q15651 99 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 PLA1AQ53H76 456 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 OR5R1Q8NH85 324 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.14□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM89A2RUT3 159 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 BTBD17A6NE02 478 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 LEUTXA8MZ59 168 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 GPR137BO60478 399 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 NOL3O60936 208 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM127O75204 238 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SERPINB10P48595 397 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB13P51153 203 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 ACTG1P63261 375 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SPCS2Q15005 226 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SETD6Q8TBK2 473 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 CREB3L1Q96BA8 519 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC25A38Q96DW6 304 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB9BQ9NP90 201 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 ETV7Q9Y603 341 aa9.13□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A075B6Q4 140 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 HKR1P10072 659 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 CEACAM3P40198 252 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 DYNLT3P51808 116 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF134P52741 427 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 HTD2P86397 168 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 GNMTQ14749 295 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 LY6EQ16553 131 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM30BQ3MIR4 351 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 Q3ZCU0 254 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF439Q8NDP4 499 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 OR52L2PQ8NGH6 319 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 GALMQ96C23 342 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 Q9N2K0 584 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 ABRACLQ9P1F3 81 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 GNG12Q9UBI6 72 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 JPT1Q9UK76 154 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SPATA2Q9UM82 520 aa9.12□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 POM121CA8CG34 1229 aa9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SERPINE3A8MV23 424 aa9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC31A2O15432 143 aa9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 RPL15P61313 204 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 MORN2Q502X0 79 aa9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 CT45A1Q5HYN5 189 aa9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00311Q8N616 119 aa9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 CT45A3Q8NHU0 189 aa9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 C1RLQ9NZP8 487 aa9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 TCF19Q9Y242 345 aa9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 YPEL1O60688 119 aa9.1□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SCGNO76038 276 aa9.1□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 CRYBA1P05813 215 aa9.1□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 FCGR3AP08637 254 aa9.1□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 SCTP09683 121 aa9.1□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 CD3GP09693 182 aa9.1□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 HLA-DRB3P79483 266 aa9.1□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 MADCAM1Q13477 382 aa9.1□□□□□ -0.95
CCL3L3-201ENST00000612839 ARL6IP1Q15041 203 aa9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms