RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603232.6

CELF4-223, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CELF4, Length 1,906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-223	ENST00000603232	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ARID1A	O14497	2285 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	SLC22A20	A6NK97	555 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	OR2C1	O95371	312 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	PRSS12	P56730	875 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	CCL20	P78556	96 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	RARRES2	Q99969	163 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	PRB1	P04280	392 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	VAMP2	P63027	116 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	IL24	Q13007	206 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	OPA3	Q9H6K4	179 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ADAM20	O43506	726 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	SFTPC	P11686	197 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	BCL3	P20749	454 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	PRDX4	Q13162	271 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	PDCD1	Q15116	288 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	GAPT	Q8N292	157 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	CXorf65	A6NEN9	183 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	HSD17B6	O14756	317 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	HBE1	P02100	147 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ABHD3	Q8WU67	409 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	SSSCA1	O60232	199 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	DFFB	O76075	338 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	SCT	P09683	121 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	PYY3	Q5JQD4	70 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	NAXE	Q8NCW5	288 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	TREM2	Q9NZC2	230 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	RFNG	Q9Y644	331 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232		A0A1B0GU03	582 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	LRP5L	A4QPB2	252 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	YIF1A	O95070	293 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	TMEM50A	O95807	157 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	HAAO	P46952	286 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	DYNLT3	P51808	116 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	TAS2R30	P59541	319 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	RAB2A	P61019	212 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	TLE4	Q04727	773 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	ATP5S	Q99766	215 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	13.09	□□□□□ -0.31
CELF4-223	ENST00000603232	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CELF4-223	ENST00000603232	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CELF4-223	ENST00000603232	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CELF4-223	ENST00000603232	WRB	O00258	174 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CELF4-223	ENST00000603232	GPR37	O15354	613 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CELF4-223	ENST00000603232	F2R	P25116	425 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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