RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 HPRT1P00492 218 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 KIR2DS4P43632 304 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 HBG1P69891 147 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 HBG2P69892 147 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 KIR2DS1Q14954 304 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 RTP5Q14D33 572 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 NECAP1Q8NC96 275 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 DIRC2Q96SL1 478 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PLK3Q9H4B4 646 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IFNL4K9M1U5 179 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 HS3ST1O14792 307 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IGKV1-5P01602 117 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 FGF12P61328 243 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ACSM6Q6P461 480 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 LINC00596Q86U02 117 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PSENENQ9NZ42 101 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 RP1P56715 2156 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 SHANK1Q9Y566 2161 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 NUPR1O60356 82 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PSMB3P49720 205 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 BADQ92934 168 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 OR4C12Q96R67 309 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 NXPH3O95157 252 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 LCATP04180 440 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IRF2P14316 349 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 NPPCP23582 126 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 RANP62826 216 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PRSS58Q8IYP2 241 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ZNF611Q8N823 705 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 HLA-CQ95604 372 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PPQ1 181 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 OPN1LWP04000 364 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 P0C879 139 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PAFAH1B2P68402 229 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 LHX4Q969G2 390 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 GPHA2Q96T91 129 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 LNP1A1A4G5 178 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 H3BP45 60 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 MMP23AO75900 390 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 UMODP07911 640 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PSG2P11465 335 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 EDN3P14138 238 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZWC4 215 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 LINC01551Q86U37 167 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 LMX1AQ8TE12 382 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 LMO7DNF2Z398 122 aa8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 DNPH1O43598 174 aa8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 JMJD7P0C870 316 aa8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 BCL3P20749 454 aa8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SOX8P57073 446 aa8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 ATP6V1FQ16864 119 aa8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.4□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 A6NNC1 897 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SOX15O60248 233 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SCGB1D1O95968 90 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 TUBG1P23258 451 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 GCH1P30793 250 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 LHX2P50458 406 aa8.39□□□□□ -1.07
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