RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598594.1

PAF1-208, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 2

Gene PAF1, Length 280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAF1-208	ENST00000598594	IGHG2	P01859	326 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	CRYBA1	P05813	215 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	P2RX1	P51575	399 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	BIK	Q13323	160 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	RHEB	Q15382	184 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	OR8G1	Q15617	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594		Q499Y3	187 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	LCN8	Q6JVE9	175 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594		Q6ZPA2	131 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	KLK6	Q92876	244 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	GPR82	Q96P67	336 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	LINC01587	Q99440	93 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594		F6UZH7	168 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594		K7EPK0	472 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PSPHP1	O15172	72 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	CCL1	P22362	96 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	GADD45A	P24522	165 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	NPY1R	P25929	384 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SELENOP	P49908	381 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	GFER	P55789	205 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	LINC00310	P59036	64 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SRPX	P78539	464 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	FABP5	Q01469	135 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	RGN	Q15493	299 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	IP6K3	Q96PC2	410 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	HES2	Q9Y543	173 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TONSL	Q96HA7	1378 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PLCH2	O75038	1416 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	C20orf202	A1L168	122 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	AIP	O00170	330 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	FFAR1	O14842	300 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF609	O15014	1411 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	PIAS1	O75925	651 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	CNTFR	P26992	372 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	DEFA3	P59666	94 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PAF1-208	ENST00000598594	RUNX3	Q13761	415 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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