RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CST11	Q9H112	138 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RGCC	Q9H4X1	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TNXB	P22105	4242 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF878	C9JN71	531 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IFNA5	P01569	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	APOC1	P02654	83 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IFNGR2	P38484	337 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GNG10	P50151	68 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BLVRA	P53004	296 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SMIM11A	P58511	58 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FXYD6P3	P58550	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HAMP	P81172	84 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64	4e-7	■■■■□ 25.2
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NMNAT3	Q96T66	252 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR52D1	Q9H346	318 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FOLR2	P14207	255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC15A1	P46059	708 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NDP	Q00604	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LIPE	Q05469	1076 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR2T4	Q8NH00	348 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		U3KQV3	271 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A1W2PPE3	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ODAM	A1E959	279 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NME4	O00746	187 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HAND1	O96004	215 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HSD11B1	P28845	292 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR3A1	P47881	315 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BNIP1	Q12981	228 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TEX30	Q5JUR7	227 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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