RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.17□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 RAB1CQ92928 201 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM80Q96HE8 168 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 C2orf48Q96LS8 159 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 SLC6A7Q99884 636 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 GAL3ST1Q99999 423 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 MICU1Q9BPX6 476 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 ESM1Q9NQ30 184 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 V9GYS6 101 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.16□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 SLC1A7O00341 560 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 CCSO14618 274 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 IGHV2-5P01817 119 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 RRASP10301 218 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 MYL12AP19105 171 aa6.16□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 ST3GAL4Q11206 333 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 WDR82Q6UXN9 313 aa6.16□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 SYS1Q8N2H4 156 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 FTMTQ8N4E7 242 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.16□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.16□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM165Q9HC07 324 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 PPIAL4DF5H284 164 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 J3QLI3 93 aa6.15□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 CDIPTO14735 213 aa6.15□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.15□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM42Q69YG0 159 aa6.15□□□□□ -1.42
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ATG4D-210ENST00000588972 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 STX19Q8N4C7 294 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 NANPQ8TBE9 248 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 FGGYQ96C11 551 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.15□□□□□ -1.42
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