RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF137P	P52743	207 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	WNT4	P56705	351 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	DGCR2	P98153	550 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743		Q8N6K4	173 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743		Q8N9W7	124 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	BANF2	Q9H503	90 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	UBE2QL1	A1L167	161 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743		H0YHG0	523 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	PDCD6	O75340	191 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	LALBA	P00709	142 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	KIR2DS1	Q14954	304 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	MMD	Q15546	238 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM104	Q8NE00	496 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	TFAP2C	Q92754	450 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	GALM	Q96C23	342 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	DERL3	Q96Q80	235 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	P2RX4	Q99571	388 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	JPT1	Q9UK76	154 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	SC5D	O75845	299 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	RANBP1	P43487	201 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	KRTAP10-11	P60412	298 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	HTD2	P86397	168 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	MORN2	Q502X0	79 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	AHSA2	Q719I0	299 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	GAPT	Q8N292	157 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	OR1L1	Q8NH94	360 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743		Q96M66	194 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	KIAA1456	Q9P272	454 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF580	Q9UK33	172 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	IGHG4	P01861	327 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	IGF1	P05019	195 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	RCN1	Q15293	331 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	FAM46B	Q96A09	425 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	RAX2	Q96IS3	184 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	B9D2	Q9BPU9	175 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	MND1	Q9BWT6	205 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-208	ENST00000579743	LINC01548	A6NM66	108 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	SLC31A2	O15432	143 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	YPEL1	O60688	119 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF134	P52741	427 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	LSAMP	Q13449	338 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	RNF152	Q8N8N0	203 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	PHYHIP	Q92561	330 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	KCTD7	Q96MP8	289 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	YPEL2	Q96QA6	119 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	GHITM	Q9H3K2	345 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	SCN3B	Q9NY72	215 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	MYF6	P23409	242 aa		10.76	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	F2RL1	P55085	397 aa		10.76	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		10.76	□□□□□ -0.69
GGA3-208	ENST00000579743	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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