RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	TM2D1	Q9BX74	207 aa		17.26	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	VCX3B	Q9H321	246 aa		17.26	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB9B	Q9NP90	201 aa		17.26	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	GNG12	Q9UBI6	72 aa		17.26	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR2C	P28335	458 aa		17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	STEAP3	Q658P3	488 aa		17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	MOB3B	Q86TA1	216 aa		17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR18	Q8N4B5	295 aa		17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNK15	Q9H427	330 aa		17.25	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		17.24	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	HSMCR30	P0CW71	290 aa		17.24	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CPE	P16870	476 aa		17.24	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		17.24	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ERICH4	A6NGS2	130 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	IL3RA	P26951	378 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CD1B	P29016	333 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPA13	P48723	471 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAM1	Q15629	374 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	MORN2	Q502X0	79 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	MGLL	Q99685	303 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	NICN1	Q9BSH3	213 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	17.23	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0A6YYD4	124 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PRX2	142 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	BPNT1	O95861	308 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHG2	P01859	326 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP2K4	P45985	399 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	HTD2	P86397	168 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZPA2	131 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		17.22	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TXNL1	O43396	289 aa		17.21	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	GNMT	Q14749	295 aa		17.21	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		17.21	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		17.21	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	JPT1	Q9UK76	154 aa		17.21	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC17A2	O00624	439 aa		17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL6IP5	O75915	188 aa		17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	NAPSA	O96009	420 aa		17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	FABP5	Q01469	135 aa		17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGN3	Q15651	99 aa		17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8N9W7	124 aa		17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CNBD2	Q96M20	576 aa		17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	17.21	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMB11	A5LHX3	300 aa		17.2	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LANCL1	O43813	399 aa		17.2	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		17.2	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		17.2	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF329	Q86UD4	541 aa		17.2	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		17.2	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	17.2	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01548	A6NM66	108 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	YPEL1	O60688	119 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	MOS	P00540	346 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ARSB	P15848	533 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	P2RY14	Q15391	338 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SVOP	Q8N4V2	548 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	GALM	Q96C23	342 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	YPEL2	Q96QA6	119 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCG5	Q9H222	651 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB26	Q9ULW5	256 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC42	Q9Y546	428 aa		17.19	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	17.18	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINE3	A8MV23	424 aa		17.18	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	17.18	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SSX1	Q16384	188 aa		17.18	■□□□□ 0.34

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