RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
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USP3-AS1-208ENST00000560962 FSTL3O95633 263 aa14.78□□□□□ -0.04
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USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM219AQ8IW50 185 aa14.78□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR51H1Q8NH63 302 aa14.78□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 C18orf12Q96KH6 178 aa14.78□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.78□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.77□□□□□ -0.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 HMSDA8MTL9 139 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 OMGP23515 440 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.77□□□□□ -0.05
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