RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 SH3GL1Q99961 368 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 EMC6Q9BV81 110 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 BCL2L14Q9BZR8 327 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 SLC19A3Q9BZV2 496 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 OR51J1Q9H342 316 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 TPK1Q9H3S4 243 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 RNF167Q9H6Y7 350 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 GLTPQ9NZD2 209 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 PLCE1Q9P212 2302 aa4.15□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0G2JMP0 313 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0J9YXY3 114 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0X1KG70 313 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 LYNX1G3V0Z9 82 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 GOSR2O14653 212 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 CHP2O43745 196 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 TPST1O60507 370 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 SNAP29O95721 258 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 LYNX1P0DP58 116 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 TUBG1P23258 451 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 AQP5P55064 265 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 TBC1D28Q2M2D7 210 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 SLC36A2Q495M3 483 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 CASC10Q5T4H9 136 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 SLC35D2Q76EJ3 337 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 HDDC2Q7Z4H3 204 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 CEND1Q8N111 149 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 SLC30A7Q8NEW0 376 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 OR4M2Q8NGB6 313 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 OR9G1Q8NH87 305 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 SYNPRQ8TBG9 265 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 RASSF5Q8WWW0 418 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 RAB1CQ92928 201 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 TLCD1Q96CP7 247 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 OR52B2Q96RD2 323 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 SUCNR1Q9BXA5 334 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 NTN4Q9HB63 628 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 TUBG2Q9NRH3 451 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 MED29Q9NX70 200 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 TAS2R5Q9NYW4 299 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 TAAR3PQ9P1P4 343 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 ANGPT4Q9Y264 503 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 USH1CQ9Y6N9 552 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 STAB1Q9NY15 2570 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 ZANQ9Y493 2812 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1W2PRG6 482 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 TRAPPC13A5PLN9 417 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 GMNCA6NCL1 334 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 CLDN25C9JDP6 229 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 M0QX08 132 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 RP2O75695 350 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 MPZL1O95297 269 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 FAM107AO95990 144 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 IGF2P01344 180 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 IGHV2-5P01817 119 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 ASAH2BP0C7U1 165 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 NR2C1P13056 603 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 SLC2A5P22732 501 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 ZBTB25P24278 435 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 APLNRP35414 380 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 APOC4P55056 127 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 ACTG1P63261 375 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 CCL8P80075 99 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 HIST3H3Q16695 136 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 TTMPQ5BVD1 217 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 ARL9Q6T311 187 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 SLC16A14Q7RTX9 510 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 LRP11Q86VZ4 500 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF584Q8IVC4 421 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 FUNDC1Q8IVP5 155 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 MSRB3Q8IXL7 192 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 C11orf42Q8N5U0 333 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 OR9I1Q8NGQ6 314 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 YIPF5Q969M3 257 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 TECTBQ96PL2 329 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
TMOD3-208ENST00000560725 SIAEQ9HAT2 523 aa4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms