RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541280.1

SUDS3-202, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SUDS3, Length 659 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-202ENST00000541280 F8VVB4 439 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 F8VWA3 439 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 H0YHG0 523 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 H3BSH0 61 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 MYL12BO14950 172 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 CA11O75493 328 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 CLPXO76031 633 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 CLIC3O95833 236 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 IGKV1D-12P01611 117 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 IGHV4-59P01825 116 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 ARG1P05089 322 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 GLAP06280 429 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 GTF2F2P13984 249 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 HTR1DP28221 377 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 BRS3P32247 399 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 DLX6P56179 175 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 WNT4P56705 351 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 RIPK1Q13546 671 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 EDDM3AQ14507 147 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 ZNF273Q14593 569 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 MPV17LQ2QL34 196 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 KRBOX4Q5JUW0 171 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 C6orf141Q5SZD1 244 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 OR2G6Q5TZ20 316 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 HCP5Q6MZN7 132 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 LIN54Q6MZP7 749 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 Q6P435 159 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 SATL1Q86VE3 508 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 ABHD12Q8N2K0 398 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 FGFRL1Q8N441 504 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 NKAIN3Q8N8D7 197 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 OR4S1Q8NGB4 309 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 OR51A2Q8NGJ7 313 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 OR10AC1Q8NH08 325 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 PHYHIPQ92561 330 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 AKR1E2Q96JD6 320 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 UQCC2Q9BRT2 126 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 MND1Q9BWT6 205 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 CLEC7AQ9BXN2 247 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 TMEM133Q9H2Q1 129 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 TNFRSF19Q9NS68 423 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 DPM3Q9P2X0 92 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 ING4Q9UNL4 249 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 LRRC42Q9Y546 428 aa4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 A0A087X0M5 115 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa4.59□□□□□ -1.67
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SUDS3-202ENST00000541280 A0A1W2PRF3 423 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 A0A1W2PRM7 423 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 ODAMA1E959 279 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 FAM90A7PA6NKC0 464 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 FAM90A22PA8MWA6 464 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 FAM90A12PA8MX19 464 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 ODF3BA8MYP8 253 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 M0QZ24 198 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 GABRPO00591 440 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 TOR1AO14656 332 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 TFF1P04155 84 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 CDK1P06493 297 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 UBBP0CG47 229 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 CCL3L1P16619 93 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 CELP19835 753 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 MDKP21741 143 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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SUDS3-202ENST00000541280 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 CD34P28906 385 aa4.59□□□□□ -1.67
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SUDS3-202ENST00000541280 OR3A1P47881 315 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 PSMD7P51665 324 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 SCN1BQ07699 218 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 KLRD1Q13241 179 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 SPHARQ15513 63 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 TRAM1Q15629 374 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 TAF9Q16594 264 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 Q3ZCU0 254 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 DDI2Q5TDH0 399 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 GLT8D1Q68CQ7 371 aa4.59□□□□□ -1.67
SUDS3-202ENST00000541280 ASPHD2Q6ICH7 369 aa4.59□□□□□ -1.67
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