RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 UFD1Q92890 307 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 TMEM203Q969S6 136 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 GALMQ96C23 342 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 COL7A1Q02388 2944 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 LINC01548A6NM66 108 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 NUDT19A8MXV4 375 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 TXNL1O43396 289 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 SC5DO75845 299 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 IGHG2P01859 326 aa7.13□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 SLC35A2P78381 396 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 EBI3Q14213 229 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 STEAP3Q658P3 488 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.13□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 SETD6Q8TBK2 473 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 MRAPQ8TCY5 172 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 NRG4Q8WWG1 115 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 PHYHIPQ92561 330 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 PHF21AQ96BD5 680 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 GON7Q9BXV9 100 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 VCX3BQ9H321 246 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 LRRC42Q9Y546 428 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 AP4M1O00189 453 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 RGS10O43665 173 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 RGS11O94810 467 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ARSBP15848 533 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 F2RL1P55085 397 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 TRAM1Q15629 374 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 TEX38Q6PEX7 206 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZPA2 131 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 GAPTQ8N292 157 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 STPG2Q8N412 459 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 Q8N9W7 124 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 S1PR3Q99500 378 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 NICN1Q9BSH3 213 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ABCG5Q9H222 651 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ZFP57Q9NU63 452 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 YPEL1O60688 119 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 MYF6P23409 242 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 CHATP28329 748 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 SOX6P35712 828 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 GPR12P47775 334 aa7.11□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 GNMTQ14749 295 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 P2RY14Q15391 338 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.11□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 COMMD1Q8N668 190 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 Q8N6K4 173 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 CYYR1Q96J86 154 aa7.11□□□□□ -1.27
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