RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532885.5

RPS6KA4-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A4, human

TSL 3

Gene RPS6KA4, Length 902 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA4-208	ENST00000532885	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DRAM1	Q8N682	238 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GALM	Q96C23	342 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HSF4	Q9ULV5	492 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SSR3	Q9UNL2	185 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SOCS1	O15524	211 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TXNL1	O43396	289 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RGS11	O94810	467 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	VEGFC	P49767	419 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	BLCAP	P62952	87 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HTD2	P86397	168 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HES1	Q14469	280 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SETD6	Q8TBK2	473 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RAB22A	Q9UL26	194 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SHISA3	A0PJX4	238 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NAPSA	O96009	420 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	REG1B	P48304	166 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HMGN3	Q15651	99 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NEDD8	Q15843	81 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TREML4	Q6UXN2	200 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MOB3B	Q86TA1	216 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CFHR4	Q92496	578 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CYYR1	Q96J86	154 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SLC31A2	O15432	143 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM11	P17152	192 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MORN2	Q502X0	79 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TPRA1	Q86W33	373 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	AK3	Q9UIJ7	227 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	YPEL1	O60688	119 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TNFAIP8	O95379	198 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGKV1D-33	P01593	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGKV1-33	P01594	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RAB6A	P20340	208 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GADD45A	P24522	165 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF137P	P52743	207 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GNMT	Q14749	295 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LYG1	Q8N1E2	194 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	YPEL2	Q96QA6	119 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PECR	Q9BY49	303 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NOTO	A8MTQ0	251 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FBXO24	O75426	580 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF134	P52741	427 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM50B	P56557	158 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FBLN7	Q53RD9	439 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885		Q6ZS46	218 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PTX4	Q96A99	478 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MMP27	Q9H306	513 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SMIM30	A4D0T7	59 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FGF16	O43320	207 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LANCL1	O43813	399 aa		13.23	□□□□□ -0.29

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