RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	DCTN3	O75935	186 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2A4	O95047	310 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM228B	P0C875	321 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF286B	P0CG31	522 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	NUDT1	P36639	197 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	CBX5	P45973	191 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	GLO1	Q04760	184 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702		Q499Y3	187 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	SMUG1	Q53HV7	270 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	GALNT10	Q86SR1	603 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	COQ8A	Q8NI60	647 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	NEURL3	Q96EH8	262 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2A7	Q96R45	310 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC01587	Q99440	93 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	PRELID1	Q9Y255	219 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702		Q9Y3F1	56 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0G2JMP0	313 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0X1KG70	313 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ACOX3	O15254	700 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	PDCD6	O75340	191 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ARL6IP5	O75915	188 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	HLA-DRA	P01903	254 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	PRTN3	P24158	256 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SLCO1A2	P46721	670 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	OMP	P47874	163 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	CRISP3	P54108	245 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP1CA	P62136	330 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	DR1	Q01658	176 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM53B	Q14153	422 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF235	Q14590	738 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	TMED2	Q15363	201 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SPINK14	Q6IE38	97 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF773	Q6PK81	442 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM205	Q6UW68	189 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	PRNT	Q86SH4	94 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	COMMD7	Q86VX2	200 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF382	Q96SR6	550 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	OR52D1	Q9H346	318 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	WFDC1	Q9HC57	220 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SNX12	Q9UMY4	172 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPRJ	Q12913	1337 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1B0GUA9	196 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	PGP	A6NDG6	321 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	BCL2L11	O43521	198 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	TCRB	P04435	133 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	IFNA16	P05015	189 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	CECR9	P0C854	216 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	CXCL8	P10145	99 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	CYBA	P13498	195 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	KLK2	P20151	261 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ME2	P23368	584 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	IL3RA	P26951	378 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	AGTR1	P30556	359 aa		2.76	□□□□□ -1.97

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