RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 WDR86Q86TI4 376 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CCL17Q92583 94 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RDH5Q92781 318 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SRRQ9GZT4 340 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 V9GYH0 126 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PP11 408 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 OOEPA6NGQ2 149 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PPIAL4DF5H284 164 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 H7C417 338 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 J3QRK9 145 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 LGALS8O00214 317 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SOCS1O15524 211 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 HAND1O96004 215 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 HLA-DQB1P01920 261 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MELTFP08582 738 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 DANCRP0C864 163 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 GNB3P16520 340 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CHATP28329 748 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PRDX2P32119 198 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RCVRNP35243 200 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 GABRA2P47869 451 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ERVK11-1P61568 191 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ACTBL2Q562R1 376 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SETD6Q8TBK2 473 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RAB1CQ92928 201 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MED30Q96HR3 178 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TMEM68Q96MH6 324 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ZNF488Q96MN9 340 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ABHD1Q96SE0 405 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CCL19Q99731 98 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 NICN1Q9BSH3 213 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PECRQ9BY49 303 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CHST6Q9GZX3 395 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 KCNK15Q9H427 330 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 HES4Q9HCC6 221 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RAB9BQ9NP90 201 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ANK2Q01484 3957 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TMEM235A6NFC5 223 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 OR2AT4A6NND4 320 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TMEM178BH3BS89 294 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SIRPB1O00241 398 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MFNGO00587 321 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 LHBP01229 141 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 IFNA6P05013 189 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SOD3P08294 240 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 IL7P13232 177 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 DAOP14920 347 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TBPP20226 339 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 DTYMKP23919 212 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 OR3A3P47888 321 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 EFNA4P52798 201 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TMEM50BP56557 158 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TMEM33P57088 247 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TAS2R46P59540 309 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PLA2G7Q13093 441 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MADCAM1Q13477 382 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ZNF79Q15937 498 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RGS21Q2M5E4 152 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.04□□□□□ -1.44
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