RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 LINC00311Q8N616 119 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-212ENST00000508338 SAMD12Q8N8I0 201 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-212ENST00000508338 OR1L1Q8NH94 360 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-212ENST00000508338 AJUBAQ96IF1 538 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-212ENST00000508338 ESM1Q9NQ30 184 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2S2Q9NQN1 319 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-212ENST00000508338 ATRQ13535 2644 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM172BPA6NC97 362 aa21.74■■□□□ 1.07
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SH3BP2-212ENST00000508338 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa21.74■■□□□ 1.07
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SH3BP2-212ENST00000508338 C17orf50Q8WW18 174 aa21.71■■□□□ 1.07
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SH3BP2-212ENST00000508338 CYYR1Q96J86 154 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV3-43DP0DP04 118 aa21.69■■□□□ 1.06
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SH3BP2-212ENST00000508338 ITGB1BP1O14713 200 aa21.68■■□□□ 1.06
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SH3BP2-212ENST00000508338 SCTP09683 121 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-212ENST00000508338 CTXN2P0C2S0 81 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF137PP52743 207 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-212ENST00000508338 CHIAQ9BZP6 476 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-212ENST00000508338 NDUFA13Q9P0J0 144 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-212ENST00000508338 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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