RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	MLST8	Q9BVC4	326 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	OR51J1	Q9H342	316 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ACER3	Q9NUN7	267 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ETV7	Q9Y603	341 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971		E5RGE8	158 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971		J3KT08	172 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	XRCC3	O43542	346 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	SOX15	O60248	233 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	SCRG1	O75711	98 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	EPPIN	O95925	133 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	CLPS	P04118	112 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV3-11	P04433	115 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	PGC	P20142	388 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	EVI2A	P22794	236 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	FPR2	P25090	351 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	GABRA3	P34903	492 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	PPIC	P45877	212 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	DEFA5	Q01523	94 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TGFBR3	Q03167	851 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TCF15	Q12870	199 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF141	Q15928	474 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	LPAL2	Q16609	132 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	RTL6	Q6ICC9	239 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971		Q6ZT83	130 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	MUC15	Q8N387	334 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	MFSD4A	Q8N468	514 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	COX18	Q8N8Q8	333 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971		Q8NA96	180 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF183	Q96D59	192 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR84	Q9NQS5	396 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	RP1	P56715	2156 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GUS0	222 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	DAPL1	A0PJW8	107 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	IDS	B3KWA1	339 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971		F8VVB4	439 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971		F8VWA3	439 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	FFAR1	O14842	300 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	FABP7	O15540	132 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TOX	O94900	526 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	NRAS	P01111	189 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	AMBP	P02760	352 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	UMOD	P07911	640 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	HKR1	P10072	659 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	MGMT	P16455	207 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	MPZ	P25189	248 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	NPY1R	P25929	384 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	NBL1	P41271	181 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	OR1E2	P47887	323 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	DAP	P51397	102 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	LOXL3	P58215	753 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	CD164	Q04900	197 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	KLRB1	Q12918	225 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	HERPUD1	Q15011	391 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	OR8B8	Q15620	311 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	CSRP2	Q16527	193 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ARL9	Q6T311	187 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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