RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 GTF2BQ00403 316 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 MED21Q13503 144 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 MMDQ15546 238 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 C4orf26Q17RF5 130 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 CLEC12BQ2HXU8 276 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 TBC1D28Q2M2D7 210 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 DNAL1Q4LDG9 190 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 ZCWPW2Q504Y3 356 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 LAIR2Q6ISS4 152 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 DRAM2Q6UX65 266 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 FAM151BQ6UXP7 276 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM251Q8N6I4 163 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 OR52E4Q8NGH9 312 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 OR5D18Q8NGL1 313 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 OR9I1Q8NGQ6 314 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 OR11L1Q8NGX0 322 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 MAL2Q969L2 176 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 SMIM12Q96EX1 92 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM208Q9BTX3 173 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 METTL9Q9H1A3 318 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 PARVGQ9HBI0 331 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 ICOSQ9Y6W8 199 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 PTPRKQ15262 1439 aa0.94□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 TENM3Q9P273 2699 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 CLUHO75153 1309 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 OR5H14A6NHG9 310 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 METTL15A6NJ78 407 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 A8MWP4 228 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 B4DEV8 164 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 H3BQ85 93 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 BIRC5O15392 142 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 ZW10O43264 779 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 STX10O60499 249 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 NIPSNAP2O75323 286 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 CDS2O95674 445 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 GPR75O95800 540 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 LTAP01374 205 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 IGKV1D-33P01593 117 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 IGKV1-33P01594 117 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 OCM2P0CE71 109 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 COX5BP10606 129 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 CTSEP14091 401 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 UGT2B7P16662 529 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 PRPS1L1P21108 318 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 CFL1P23528 166 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 GADD45AP24522 165 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 AGTR1P30556 359 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 EVI2BP34910 448 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 COILP38432 576 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 INPP1P49441 399 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 FOXA1P55317 472 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 SMAGPQ0VAQ4 97 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 C1DQ13901 141 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 CASP8Q14790 479 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 LRRC26Q2I0M4 334 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 HLA-DRB5Q30154 266 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 CENPWQ5EE01 88 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 DNM1P34Q6PK57 102 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 TCF23Q7RTU1 214 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 VN1R4Q7Z5H5 301 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 CPNE9Q8IYJ1 553 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 OR4A5Q8NH83 315 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 OR5K1Q8NHB7 308 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 ZNRF2Q8NHG8 242 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 SPPL2BQ8TCT7 592 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 KCTD4Q8WVF5 259 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 TAMM41Q96BW9 452 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 PPCDCQ96CD2 204 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 CMBLQ96DG6 245 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 CMTM5Q96DZ9 223 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 SMIM19Q96E16 107 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 PYURFQ96I23 114 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 TSSK6Q9BXA6 273 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 POTEKPQ9BYX7 375 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 USE1Q9NZ43 259 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM216Q9P0N5 145 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 GLS2Q9UI32 602 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 MTCH2Q9Y6C9 303 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 ARAP3Q8WWN8 1544 aa0.93□□□□□ -2.26
UBE2B-202ENST00000499038 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms