RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		13.88	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424		M0QZK8	103 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	MMP23A	O75900	390 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH3B2	P48448	385 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	TFAP2A	P05549	437 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CD3G	P09693	182 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	TALDO1	P37837	337 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB13	P51153	203 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	VBP1	P61758	197 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFA6	Q01524	100 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424		Q3ZCU0	254 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	GAPT	Q8N292	157 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	RFESD	Q8TAC1	157 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SETD6	Q8TBK2	473 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	PECR	Q9BY49	303 aa		13.86	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0A6YYD4	124 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0B4J203	849 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	OPN1MW	P04001	364 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	PAX6	P26367	422 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SSTR5	P35346	364 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	MNDA	P41218	407 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	RORC	P51449	518 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	LTC4S	Q16873	150 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR18	Q8N4B5	295 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	MMP28	Q9H239	520 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	AK3	Q9UIJ7	227 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINE3	A8MV23	424 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2F2	O95006	317 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	NCS1	P62166	190 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	ARFRP1	Q13795	201 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	AP3S1	Q92572	193 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	GALM	Q96C23	342 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424	GNG12	Q9UBI6	72 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A075B6Q4	140 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0A6YYH2	397 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424		A6NJ64	397 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424		J3QR06	171 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS11	O94810	467 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GABARAP	O95166	117 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	HBZ	P02008	142 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM50B	P56557	158 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PITPNA	Q00169	270 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	MZT2A	Q6P582	158 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM219	Q86XT9	240 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf77	C9JDV5	145 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	C15orf65	H3BRN8	121 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PEX14	O75381	377 aa		13.82	□□□□□ -0.2

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