RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	OR5R1	Q8NH85	324 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	AP3S1	Q92572	193 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	TRIM77	I1YAP6	450 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	XRCC3	O43542	346 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	YPEL1	O60688	119 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	APOA1	P02647	267 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	CD3G	P09693	182 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	NFYB	P25208	207 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	CDNF	Q49AH0	187 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	YPEL2	Q96QA6	119 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM172BP	A6NC97	362 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	LEUTX	A8MZ59	168 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	MNDA	P41218	407 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	KIR2DS4	P43632	304 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	PIFO	Q8TCI5	191 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	GALM	Q96C23	342 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM235	A6NFC5	223 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	TOR1A	O14656	332 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	TPPP	O94811	219 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV4-59	P01825	116 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	CEACAM3	P40198	252 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	MORN2	Q502X0	79 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	UBALD1	Q8TB05	177 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	GNG12	Q9UBI6	72 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	SSX5	O60225	188 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	RGS11	O94810	467 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF134	P52741	427 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	MADCAM1	Q13477	382 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	GNMT	Q14749	295 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	MZT2A	Q6P582	158 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	LEAP2	Q969E1	77 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PPI3	338 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	FABP7	O15540	132 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	SCT	P09683	121 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	SOX6	P35712	828 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	ARFRP1	Q13795	201 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	SSX2	Q16385	188 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	LTC4S	Q16873	150 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	C16orf87	Q6PH81	154 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	PRR18	Q8N4B5	295 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	SSX3	Q99909	188 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	CHIA	Q9BZP6	476 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A075B6Q4	140 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.34	□□□□□ -0.27

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