RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	BANF2	Q9H503	90 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SORL1	Q92673	2214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TG	P01266	2768 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792		A0A1W2PPI3	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	IFITM5	A6NNB3	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792		H3BUX3	64 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RAB27B	O00194	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	DIRAS3	O95661	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	HTR1D	P28221	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RAB13	P51153	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RAG2	P55895	527 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	HTD2	P86397	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SCN1B	Q07699	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	GNMT	Q14749	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MLANA	Q16655	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792		Q6ZS49	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792		Q8N6K4	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CST11	Q9H112	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MMP28	Q9H239	520 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792		Q9H521	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792		V9GY05	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	AIP	O00170	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	YPEL1	O60688	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM127	O75204	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ARG1	P05089	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ARSB	P15848	533 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	NAT1	P18440	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PRRX1	P54821	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	LGALS4	P56470	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CLDN12	P56749	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ACTG1	P63261	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	HMGN3	Q15651	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SSX2	Q16385	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MORN2	Q502X0	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	S100A13	Q99584	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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