RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 ECI1P42126 302 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 LOXL3P58215 753 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 ARF6P62330 175 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 HERPUD1Q15011 391 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 DHRS11Q6UWP2 260 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 PRR18Q8N4B5 295 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 Q8N7P7 452 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 OR1L1Q8NH94 360 aa10.69□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa10.68□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 OR5H8P0DN80 308 aa10.68□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 DEFA3P59666 94 aa10.68□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 J3QRK9 145 aa10.67□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 TUSC2O75896 110 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 SLC22A5O76082 557 aa10.67□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 OMGP23515 440 aa10.67□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 TSPAN5P62079 268 aa10.67□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 OR11H6Q8NGC7 330 aa10.67□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 RDH8Q9NYR8 311 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 OR2W1Q9Y3N9 320 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP10.67□□□□□ -0.79e-7■□□□□ 10.5
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NISCH-208ENST00000481211 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 NFYBP25208 207 aa10.66□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 FAHD2AQ96GK7 314 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 SCGB3A2Q96PL1 93 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 TBX15Q96SF7 602 aa10.66□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 PPYP01298 95 aa10.65□□□□□ -0.7
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NISCH-208ENST00000481211 CD99P14209 185 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 IL3RAP26951 378 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 FCGR2CP31995 323 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 LUMP51884 338 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 UCP3P55916 312 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-208ENST00000481211 HERV-K104P61576 105 aa10.65□□□□□ -0.7
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