RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 PHYHIPLQ96FC7 376 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 CCL19Q99731 98 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 Q9N2K0 584 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 HECTD1Q9ULT8 2610 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 PPIHO43447 177 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 OR2F2O95006 317 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 TK1P04183 234 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 OR4E1P0C645 316 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 SLC25A4P12235 298 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 EDDM3BP56851 147 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 OR2F1Q13607 317 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 KRBOX4Q5JUW0 171 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF787Q6DD87 383 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF525Q8N782 197 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 POM121Q96HA1 1249 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 CTSZQ9UBR2 303 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.04■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa15.03■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 K7N7A8 449 aa15.03■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 CA11O75493 328 aa15.03■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 CD74P04233 296 aa15.03■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 CHRFAM7AQ494W8 412 aa15.03■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 LY6G6FQ5SQ64 297 aa15.03■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 KCNRGQ8N5I3 272 aa15.03■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 MRGPRDQ8TDS7 321 aa15.03■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 IGFBPL1Q8WX77 278 aa15.03■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 ST8SIA2Q92186 375 aa15.03■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 POM121CA8CG34 1229 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 MPTX1A8MV57 137 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 ADAM20O43506 726 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV4-39P01824 125 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 HLA-GP17693 338 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 OR5M8Q8NGP6 311 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 MRGPRFQ96AM1 343 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 EHFQ9NZC4 300 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-217ENST00000475693 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 F12P00748 615 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 RLN2P04090 185 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 DTYMKP23919 212 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 CBX5P45973 191 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ERVFRD-1P60508 538 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 HERPUD1Q15011 391 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF546Q86UE3 836 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 OR5AP2Q8NGF4 316 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 OR13A1Q8NGR1 328 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 OR5H2Q8NGV7 314 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 RFESDQ8TAC1 157 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 SDSLQ96GA7 329 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 SNX22Q96L94 193 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF665Q9H7R5 613 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM17Q86X19 198 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 SLC2A8Q9NY64 477 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 NDUFA2O43678 99 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 SPDEFO95238 335 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 NDUFB7P17568 137 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 KIRREL1Q96J84 757 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 SIGLEC5O15389 551 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV2-70P01814 119 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 SSTR5P35346 364 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 EFNA4P52798 201 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 IL13RA1P78552 427 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 LTC4SQ16873 150 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 UQCC3Q6UW78 93 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF561Q8N587 486 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 OR13C8Q8NGS7 320 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF286AQ9HBT8 521 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 TNFSF18Q9UNG2 199 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 OR5H14A6NHG9 310 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 GLAP06280 429 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 OMGP23515 440 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 UTF1Q5T230 341 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 LIN54Q6MZP7 749 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 OR1L1Q8NH94 360 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 PERPQ96FX8 193 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 BCL2L11O43521 198 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 IFNA6P05013 189 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 GLP1RP43220 463 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 NPY4RP50391 375 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 MEF2DQ14814 521 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 GAPTQ8N292 157 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms