RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 HTD2P86397 168 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 NEDD8Q15843 81 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 MORN2Q502X0 79 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 OR8H3Q8N146 312 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 DRAM1Q8N682 238 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 OR56B4Q8NH76 319 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 CFHR4Q92496 578 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 GALMQ96C23 342 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 OR51E2Q9H255 320 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 AK3Q9UIJ7 227 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 RAB22AQ9UL26 194 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 HSF4Q9ULV5 492 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 SSR3Q9UNL2 185 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 SMIM30A4D0T7 59 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 HSD17B6O14756 317 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 YPEL1O60688 119 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 NAPSAO96009 420 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 IL3RAP26951 378 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 REG1BP48304 166 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 HES1Q14469 280 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 HERPUD1Q15011 391 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 HMGN3Q15651 99 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 STEAP3Q658P3 488 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZPA2 131 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 MOB3BQ86TA1 216 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 SETD6Q8TBK2 473 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 YPEL2Q96QA6 119 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 PECRQ9BY49 303 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 JPT1Q9UK76 154 aa7.31□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 A0A0B4J203 849 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 NOTOA8MTQ0 251 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 M0QZ24 198 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 PEX14O75381 377 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 IGKV1D-33P01593 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 IGKV1-33P01594 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 AMY1AP04745 511 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 AMY2AP04746 511 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 LPLP06858 475 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 CD36P16671 472 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TMEM11P17152 192 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 RAB6AP20340 208 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 GADD45AP24522 165 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ZNF137PP52743 207 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 EBI3Q14213 229 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 HNF4GQ14541 408 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 GNMTQ14749 295 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TREML4Q6UXN2 200 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TPRA1Q86W33 373 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 LYG1Q8N1E2 194 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.3□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 A0A087WXM4 84 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 M0QZK8 103 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 RGS11O94810 467 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TNFAIP8O95379 198 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 SCTP09683 121 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 GNB3P16520 340 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 CD1BP29016 333 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 SDC2P34741 201 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.29□□□□□ -1.24
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