RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 HSD17B6O14756 317 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 IL3RAP26951 378 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM50BP56557 158 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 BLCAPP62952 87 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 PRR31Q5SQ13 230 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 DRAM1Q8N682 238 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF439Q8NDP4 499 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 OR56B4Q8NH76 319 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 SLC25A33Q9BSK2 321 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 OR51E2Q9H255 320 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 AK3Q9UIJ7 227 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 SLC31A2O15432 143 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 OR2F2O95006 317 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 HTD2P86397 168 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 PLA2G7Q13093 441 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 HMGN3Q15651 99 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 FBLN7Q53RD9 439 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF880Q6PDB4 577 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 Q6ZTK2 550 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 MOB1BQ7L9L4 216 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 C5orf24Q7Z6I8 188 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 NR2C2APQ86WQ0 139 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 SETD6Q8TBK2 473 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 CFHR4Q92496 578 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 GALMQ96C23 342 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 ABRACLQ9P1F3 81 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 JPT1Q9UK76 154 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 MGAM2Q2M2H8 2515 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 SMIM30A4D0T7 59 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 TNFAIP8O95379 198 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 CD36P16671 472 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 REG1BP48304 166 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF134P52741 427 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 MORN2Q502X0 79 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 CT45A1Q5HYN5 189 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 STEAP3Q658P3 488 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 Q6ZPA2 131 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 TPRA1Q86W33 373 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 KLHDC1Q8N7A1 406 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 OR52L2PQ8NGH6 319 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 CT45A3Q8NHU0 189 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 PECRQ9BY49 303 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 SERTAD4Q9NUC0 356 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 A0A0B4J203 849 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 NOTOA8MTQ0 251 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 VSIG10L2P0DP72 767 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 RAB6AP20340 208 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 GNMTQ14749 295 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 PLAC9Q5JTB6 97 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 Q6ZS46 218 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 MOB3BQ86TA1 216 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 KCTD7Q96MP8 289 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 C12orf4Q9NQ89 552 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-206ENST00000470271 A0A087WXM4 84 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 RGS11O94810 467 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 LPLP06858 475 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 GADD45AP24522 165 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF137PP52743 207 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 HES1Q14469 280 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 HERPUD1Q15011 391 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 TSPAN14Q8NG11 270 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 PTX4Q96A99 478 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 RAB3CQ96E17 227 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 M0QZ24 198 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 M0QZK8 103 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 YPEL1O60688 119 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 PEX14O75381 377 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 IGKV1D-33P01593 117 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 IGKV1-33P01594 117 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM11P17152 192 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 MOGAT2Q3SYC2 334 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 ABCA11PQ4W5N1 156 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 LY6G6FQ5SQ64 297 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 LYG1Q8N1E2 194 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-206ENST00000470271 YPEL2Q96QA6 119 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms