RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR4A16Q8NH70 328 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 SNX22Q96L94 193 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 MANBALQ9NQG1 85 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 A1L4Q6 167 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 LYZL6O75951 148 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 AMTP48728 403 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 NRN1LQ496H8 165 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 PROK2Q9HC23 129 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 Q0VFX4 171 aa6.64□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 RAB32Q13637 225 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.64□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 SSSCA1O60232 199 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 FAM3AP98173 230 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 CXCL2P19875 107 aa6.64□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 PMCHP20382 165 aa6.64□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.64□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 IKZF1Q13422 519 aa6.64□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.64□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR2C3Q8N628 320 aa6.64□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TP53RKQ96S44 253 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 TIMP3P35625 211 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 FAM222BQ8WU58 562 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 PSENENQ9NZ42 101 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 KCNAB3O43448 404 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 GRPP07492 148 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ZNF708P17019 499 aa6.63□□□□□ -1.35
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