RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 ARL6IP5O75915 188 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 OPN1MWP04001 364 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 OPN1MW2P0DN77 364 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 OPN1MW3P0DN78 364 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 TGFBR1P36897 503 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 RPS19P39019 145 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 RAB7AP51149 207 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 LOXL3P58215 753 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 MADCAM1Q13477 382 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 MZT2AQ6P582 158 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFA11Q86Y39 141 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 MFSD4AQ8N468 514 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00311Q8N616 119 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM104Q8NE00 496 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 ACOT12Q8WYK0 555 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 ARL11Q969Q4 196 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM203Q969S6 136 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 TMED9Q9BVK6 235 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 ADAM30Q9UKF2 790 aa10.54□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PPI3 338 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 M0QZK8 103 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 PEX14O75381 377 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3-7P01780 117 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 MGMTP16455 207 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 CD83Q01151 205 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 INSL4Q14641 139 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 LTC4SQ16873 150 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 Q3ZCU0 254 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 AWAT2Q6E213 333 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 SIGIRRQ6IA17 410 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 LRRTM1Q86UE6 522 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 OR8H3Q8N146 312 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 CAPSLQ8WWF8 208 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 TOMM40LQ969M1 308 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 Q96M66 194 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 BANF2Q9H503 90 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 RNF167Q9H6Y7 350 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf3-210ENST00000462125 AIPO00170 330 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 FUT3P21217 361 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 SDC2P34741 201 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 EBI3Q14213 229 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 RGS21Q2M5E4 152 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM95Q3KNT9 176 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 ABCA11PQ4W5N1 156 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 C1orf100Q5SVJ3 147 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 RAB12Q6IQ22 244 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 DRAM1Q8N682 238 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 OR5AU1Q8NGC0 362 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 OR10X1Q8NGY0 326 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 NEK7Q8TDX7 302 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC107Q8WV48 283 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC32Q9BV29 185 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 SELENOIQ9C0D9 397 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 GFOD1Q9NXC2 390 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 ETAA1Q9NY74 926 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 NOTCH1P46531 2555 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PPE3 182 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 C12orf77C9JDV5 145 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 LPLP06858 475 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 UBBP0CG47 229 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 SRMP19623 302 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.731e-7■■■□□ 14.7
C9orf3-210ENST00000462125 GNG10P50151 68 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM30BQ3MIR4 351 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 FAM27D1Q5T7N8 215 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 STEAP3Q658P3 488 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF554Q86TJ5 538 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC190Q86UF4 302 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 OR56B4Q8NH76 319 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 CST11Q9H112 138 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 RAB9BQ9NP90 201 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 J3QRK9 145 aa10.5□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 PDCD5O14737 125 aa10.5□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 RGS5O15539 181 aa10.5□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 UCHL1P09936 223 aa10.5□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 MXD1Q05195 221 aa10.5□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa10.5□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 C6orf183Q5T699 404 aa10.5□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 GLT8D1Q68CQ7 371 aa10.5□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
C9orf3-210ENST00000462125 TRAT1Q6PIZ9 186 aa10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.1 ms