RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 M0R1W7 72 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 HSPB6O14558 160 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 HPGDSO60760 199 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB6AP20340 208 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB13P51153 203 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 PAX5Q02548 391 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB12Q6IQ22 244 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 COA4Q9NYJ1 87 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 ONECUT1Q9UBC0 465 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PPE2 198 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PR64 198 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PRV1 198 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 PDCD6O75340 191 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 TOX4O94842 621 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 AVPP01185 164 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 AKR1D1P51857 326 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 SCAND1P57086 179 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 AESQ08117 197 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 IDNKQ5T6J7 187 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 STX12Q86Y82 276 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 NANPQ8TBE9 248 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 NEK7Q8TDX7 302 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 SIRPDQ9H106 197 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 STAB1Q9NY15 2570 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 SRP14P37108 136 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 GLIPR1P48060 266 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 RAG2P55895 527 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 ST8SIA2Q92186 375 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 CORO2AQ92828 525 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 COQ2Q96H96 371 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 NICN1Q9BSH3 213 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 ODAMA1E959 279 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 H7C2Y5 167 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 CA11O75493 328 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 IFNA4P05014 189 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF728P0DKX0 622 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 MMP9P14780 707 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 CHATP28329 748 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 BRICD5Q6PL45 260 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF714Q96N38 554 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 OR51J1Q9H342 316 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 BIN3Q9NQY0 253 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 ABRACLQ9P1F3 81 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 COPZ2Q9P299 210 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 ETV7Q9Y603 341 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0A6YYD4 124 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 MPTX1A8MV57 137 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 VEGFCP49767 419 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 TBX15Q96SF7 602 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 HSF4Q9ULV5 492 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 C17orf98A8MV24 154 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 SOCS1O15524 211 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 MPC2O95563 127 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms