RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448310.1

CBX4-202, Transcript of chromobox 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene CBX4, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX4-202ENST00000448310 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 UBE2QL1A1L167 161 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 ELANEP08246 267 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 VSIG8P0DPA2 414 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 MGMTP16455 207 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 VDAC1P21796 283 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 MED21Q13503 144 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 GNMTQ14749 295 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 RAB9BQ9NP90 201 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 MYF6P23409 242 aa22.12■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 ST3GAL4Q11206 333 aa22.12■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 TMEM30BQ3MIR4 351 aa22.12■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 SIGIRRQ6IA17 410 aa22.12■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 OR5M8Q8NGP6 311 aa22.12■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 DERL3Q96Q80 235 aa22.12■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 TAF9BQ9HBM6 251 aa22.12■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 OR2S2Q9NQN1 319 aa22.12■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 RYR3Q15413 4870 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 IGHG4P01861 327 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 GP2P55259 537 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 LSAMPQ13449 338 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 DOC2BQ14184 412 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 TTC23Q5W5X9 447 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 LYPD6Q86Y78 171 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 OR52L2PQ8NGH6 319 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 Q96M66 194 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 KCTD7Q96MP8 289 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 PRR25Q96S07 402 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 LANCL1O43813 399 aa22.1■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 SC5DO75845 299 aa22.1■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 CAPGP40121 348 aa22.1■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 MORN2Q502X0 79 aa22.1■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 TRAT1Q6PIZ9 186 aa22.1■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 SETD9Q8NE22 299 aa22.1■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 FAM46BQ96A09 425 aa22.1■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa22.1■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 RAMP3O60896 148 aa22.09■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 FUT3P21217 361 aa22.09■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 MMDQ15546 238 aa22.09■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 C9orf66Q5T8R8 295 aa22.09■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 FAM90A10PA6NDY2 464 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 FAM90A7PA6NKC0 464 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 CA11O75493 328 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 IGF1P05019 195 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 CELP19835 753 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 PSMB8P28062 276 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 TAS2R43P59537 309 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 STEAP3Q658P3 488 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 CDH26Q8IXH8 852 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 C4orf3Q8WVX3 66 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 RITA1Q96K30 269 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 KCNIP1Q9NZI2 227 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX4-202ENST00000448310 SEC14L6B5MCN3 397 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 CNTFRP26992 372 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 ECI1P42126 302 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 LAIR2Q6ISS4 152 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 ODF3L1Q8IXM7 274 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 DHRSXQ8N5I4 330 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 WSB1Q9Y6I7 421 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 EFCAB10A6NFE3 127 aa22.06■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 PDCD6O75340 191 aa22.06■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 GLAP06280 429 aa22.06■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 ACTBP60709 375 aa22.06■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 NKAPLQ5M9Q1 402 aa22.06■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 OR11H1Q8NG94 326 aa22.06■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 KLK15Q9H2R5 256 aa22.06■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 SCOCQ9UIL1 159 aa22.06■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 G3V318 75 aa22.05■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 EBAG9O00559 213 aa22.05■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 FHL3Q13643 280 aa22.05■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 AHSA2Q719I0 299 aa22.05■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 NKAIN3Q8N8D7 197 aa22.05■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 NABP2Q9BQ15 211 aa22.05■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 GNB4Q9HAV0 340 aa22.05■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 ZNF580Q9UK33 172 aa22.05■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 JPT1Q9UK76 154 aa22.05■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 MYL12BO14950 172 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 ATP6V0E1O15342 81 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 GNAO1P09471 354 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 OR5H8P0DN80 308 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 OR3A3P47888 321 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 WNT4P56705 351 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 INSL4Q14641 139 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 MYOZ3Q8TDC0 251 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 UQCC2Q9BRT2 126 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 PARP11Q9NR21 331 aa22.04■■□□□ 1.12
CBX4-202ENST00000448310 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms