RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 CEACAM16Q2WEN9 425 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A25Q6T423 547 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXB1Q99853 325 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL9Q9H1A3 318 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 NF1P21359 2839 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DSCAMO60469 2012 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 POLQO75417 2590 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C9J4A7 227 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MLNRO43193 412 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 NRASP01111 189 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DLK1P80370 383 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 IL24Q13007 206 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF154Q13106 437 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SSX2Q16385 188 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL24Q6TFL4 600 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2M7Q8NG81 312 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PGAM5Q96HS1 289 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4C12Q96R67 309 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 AKAP6Q13023 2319 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 G3V3Y1 287 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CHST1O43916 411 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PSPNO60542 156 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CELA3AP09093 270 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF146Q15072 292 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF114Q8NC26 417 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 AGBL5Q8NDL9 886 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51I2Q9H344 312 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ITPR3Q14573 2671 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 B4E171 279 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN7P41732 249 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FUT6P51993 359 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A1Q86YD7 464 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ELOVL1Q9BW60 279 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 KLRF1Q9NZS2 232 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFA4P12838 97 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MSMPQ1L6U9 139 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MPV17LQ2QL34 196 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2V1Q8NHB1 315 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TCEAL3Q969E4 200 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SGCZQ96LD1 299 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RSG1Q9BU20 258 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEK2Q9NYT0 353 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CBR3O75828 277 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRR1P24046 479 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DRB3P79483 266 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF616Q08AN1 781 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZR03 302 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SLAMF9Q96A28 289 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.05□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM210A6NLX4 147 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RHBDL1O75783 438 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TCN2P20062 427 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CARD17Q5XLA6 110 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PMS2CLQ68D20 193 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DPPA3Q6W0C5 159 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB119Q8N690 84 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM105Q8N8V8 129 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD3Q8WU67 409 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5H1A6NKK0 313 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNHIT1O43257 154 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ALKBH6Q3KRA9 238 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 THNSL2Q86YJ6 484 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR14L1PQ8NHC6 308 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
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