RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409627.6

SUMO1-208, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 722 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-208	ENST00000409627	GNG12	Q9UBI6	72 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	HIVEP2	P31629	2446 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	FAM172BP	A6NC97	362 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	YPEL1	O60688	119 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	NAT1	P18440	290 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	UTF1	Q5T230	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	OR52I2	Q8NH67	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	YPEL2	Q96QA6	119 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	BEX2	Q9BXY8	128 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	NPFF	O15130	113 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	RGS11	O94810	467 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ZBTB25	P24278	435 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	RCVRN	P35243	200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ACTB	P60709	375 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ACTG1	P63261	375 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	GNMT	Q14749	295 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF79	Q15937	498 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	MORN2	Q502X0	79 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	MIDN	Q504T8	468 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	IGSF11	Q5DX21	431 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF596	Q8TC21	504 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	PSG11	Q9UQ72	335 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUMO1-208	ENST00000409627	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627		J3QR06	171 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	TOR1A	O14656	332 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	HSPA12A	O43301	675 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	RBBP9	O75884	186 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	ARG1	P05089	322 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	PRRX1	P54821	245 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	DGCR2	P98153	550 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	LINC00311	Q8N616	119 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	LEAP2	Q969E1	77 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627		A0A1W2PRD5	423 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627		A0A1W2PRF3	423 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627		A0A1W2PRM7	423 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	BET1	O15155	118 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	CRLF1	O75462	422 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	IGHV3-7	P01780	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	FCER2	P06734	321 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	SRD5A1	P18405	259 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	SAA4	P35542	130 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	GNG10	P50151	68 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	TAS2R46	P59540	309 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	ARPC4	P59998	168 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF45	Q02386	682 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	SCGB2A2	Q13296	93 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	MMP28	Q9H239	520 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	KLK11	Q9UBX7	282 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	EPHA1	P21709	976 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	CEACAM6	P40199	344 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	LGALS4	P56470	323 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	CDK10	Q15131	360 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	PYDC2	Q56P42	97 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SUMO1-208	ENST00000409627	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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