RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402555.2

HMGB1P20-201, Transcript of high mobility group box 1 pseudogene 20, humanhuman

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Gene HMGB1P20, Length 677 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P20-201ENST00000402555 SRMP19623 302 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 GZMHP20718 246 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 CHATP28329 748 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 HTR2CP28335 458 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 MNDAP41218 407 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 HSPA13P48723 471 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 ARHGDIBP52566 201 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 CLDN12P56749 244 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 LOXL3P58215 753 aa4.59□□□□□ -1.67
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HMGB1P20-201ENST00000402555 DEFA6Q01524 100 aa4.59□□□□□ -1.67
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HMGB1P20-201ENST00000402555 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 UNC119Q13432 240 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 TPBGQ13641 420 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 HES1Q14469 280 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 GNMTQ14749 295 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 SSX1Q16384 188 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 GLT8D1Q68CQ7 371 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 C11orf88Q6PI97 169 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 PRSS48Q7RTY5 328 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 C6orf201Q7Z4U5 140 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 MOB3BQ86TA1 216 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 OR10X1Q8NGY0 326 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 PHYHIPQ92561 330 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 THRSPQ92748 146 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 CREB3L1Q96BA8 519 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 MGLLQ99685 303 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 SULT4A1Q9BR01 284 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 UQCC2Q9BRT2 126 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 TMEM59Q9BXS4 323 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 CST11Q9H112 138 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 VCX3BQ9H321 246 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 TAF9BQ9HBM6 251 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 SPACA1Q9HBV2 294 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 GNG12Q9UBI6 72 aa4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HMGB1P20-201ENST00000402555 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 TMEM14DPA8MWL7 114 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 CCRL2O00421 344 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 SLC22A1O15245 554 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 SOCS1O15524 211 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 SPINT2O43291 252 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 UBBP0CG47 229 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 CPEP16870 476 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 TMEM11P17152 192 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 RAB7AP51149 207 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 ZNF134P52741 427 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 QRFPP83859 136 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 PLA2G7Q13093 441 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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HMGB1P20-201ENST00000402555 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 C6orf183Q5T699 404 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 Q6ZPA2 131 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 C16orf82Q7Z2V1 217 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 THNSL2Q86YJ6 484 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 OR8H3Q8N146 312 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 GAPTQ8N292 157 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 LINC00311Q8N616 119 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 ZNF439Q8NDP4 499 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 OR5AU1Q8NGC0 362 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 OR52M1Q8NGK5 317 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 OR6M1Q8NGM8 313 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 CT45A3Q8NHU0 189 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 KCNG3Q8TAE7 436 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 R3HDM4Q96D70 268 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 AKR1E2Q96JD6 320 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 NEDD4LQ96PU5 975 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 PLGRKTQ9HBL7 147 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 ISYNA1Q9NPH2 558 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 ACOT13Q9NPJ3 140 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 GHRLQ9UBU3 117 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 LINC00527Q9UJ94 153 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 RAB26Q9ULW5 256 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.58□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 A0A0B4J203 849 aa4.57□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 SHISA3A0PJX4 238 aa4.57□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 SMIM30A4D0T7 59 aa4.57□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 LINC01548A6NM66 108 aa4.57□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 G3V4G9 280 aa4.57□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 H3BUI4 141 aa4.57□□□□□ -1.68
HMGB1P20-201ENST00000402555 SLC17A2O00624 439 aa4.57□□□□□ -1.68
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