RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCL21O00585 134 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C8orf89P0DMQ9 161 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FERP16591 822 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPRR1BP22528 89 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL32P24001 234 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CRYBB3P26998 211 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NDUFA8P51970 172 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RHBDL3P58872 404 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FOXI2Q6ZQN5 318 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LPCAT2Q7L5N7 544 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BOD1L2Q8IYS8 172 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ELMOD2Q8IZ81 293 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IQCKQ8N0W5 287 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LPCAT1Q8NF37 534 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PSMA8Q8TAA3 256 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OCC1Q8TAD7 63 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCTD4Q8WVF5 259 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ING5Q8WYH8 240 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYLPFQ96A32 169 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CFAP36Q96G28 342 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MS4A4EQ96PG1 132 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TSSK6Q9BXA6 273 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PARD6BQ9BYG5 372 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANXA2P2A6NMY6 339 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WASH3PC4AMC7 463 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C9J4A7 227 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 F2Z2F3 143 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYL12BO14950 172 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 COX7A2P2O60397 106 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LSM8O95777 96 aaKnown RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AP2A1O95782 977 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CASP2P42575 452 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SSTP61278 116 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C1orf185Q5T7R7 199 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TPGS2Q68CL5 300 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 Q6ZSR3 168 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLEC4FQ8N1N0 589 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNF148Q8N7C7 305 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR10J5Q8NHC4 309 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AKR7LQ8NHP1 331 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MITD1Q8WV92 249 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHP1Q99653 195 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ACPTQ9BZG2 426 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BPESC1Q9GZL8 116 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXO5Q9UKT4 447 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SNX12Q9UMY4 172 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SNX24Q9Y343 169 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNF222A6NCQ9 220 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TVP23AA6NH52 213 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF815PA8K554 130 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NDUFS8O00217 210 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TXNDC9O14530 226 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRKAB2O43741 272 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MBP02144 154 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GCH1P30793 250 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MC5RP33032 325 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAB9AP51151 201 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCL11P51671 97 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DGUOKQ16854 277 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IQCJQ1A5X6 159 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM236Q5W0B7 351 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF826PQ6ZT77 177 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C10orf111Q8N326 155 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLDND2Q8NHS1 167 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OPTNQ96CV9 577 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C12orf66Q96MD2 445 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC50A1Q9BRV3 221 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC25A31Q9H0C2 315 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARV1Q9H2C2 271 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NIPAL2Q9H841 368 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM138Q9NPI0 162 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BAIAP2Q9UQB8 552 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms