RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
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PTPRK-207ENST00000368226 UQCC3Q6UW78 93 aa11.13□□□□□ -0.63
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PTPRK-207ENST00000368226 SPSB2Q99619 263 aa11.13□□□□□ -0.63
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PTPRK-207ENST00000368226 PLA2G10O15496 165 aa11.13□□□□□ -0.63
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PTPRK-207ENST00000368226 LINC00596Q86U02 117 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRK-207ENST00000368226 LRRC75AQ8NAA5 344 aa11.13□□□□□ -0.63
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PTPRK-207ENST00000368226 PERPQ96FX8 193 aa11.13□□□□□ -0.63
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PTPRK-207ENST00000368226 KIR3DP1A8MWS1 328 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRK-207ENST00000368226 SULT1A1P50225 295 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRK-207ENST00000368226 PRO1933Q9H354 126 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRK-207ENST00000368226 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRK-207ENST00000368226 LTBRP36941 435 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRK-207ENST00000368226 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRK-207ENST00000368226 TEPPQ6URK8 271 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRK-207ENST00000368226 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRK-207ENST00000368226 WNT2BQ93097 391 aa11.13□□□□□ -0.63
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