RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPIBP23284 216 aaKnown RBP-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDKN2DP55273 166 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KYNUQ16719 465 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TSTQ16762 297 aaKnown RBP-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RTL4Q6ZR62 310 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SSX6Q7RTT6 188 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 P4HA3Q7Z4N8 544 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF738Q8NE65 137 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM185AQ8NFB2 350 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR10K1Q8NGX5 313 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR1L1Q8NH94 360 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NDNFQ8TB73 568 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCT6BQ92526 530 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PKNOX2Q96KN3 472 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NPY6RQ99463 290 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ACBD6Q9BR61 282 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ITPAQ9BY32 194 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR2H1Q9GZK4 316 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR51I1Q9H343 314 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MORF4L1Q9UBU8 362 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CYTH4Q9UIA0 394 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC13A4Q9UKG4 626 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CES1P1Q9UKY3 287 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMED5Q9Y3A6 229 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CUX2O14529 1486 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DEPDC5O75140 1603 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MON2Q7Z3U7 1717 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAPPC13A5PLN9 417 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KBTBD13C9JR72 458 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H3BMM0 161 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TCAPO15273 167 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 P4HA2O15460 535 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KDELR3O43731 214 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KLHL41O60662 606 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 E2F6O75461 281 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LGALS2P05162 132 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHRNGP07510 517 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD3GP09693 182 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C8orf89P0DMQ9 161 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP-2.92□□□□□ -2.88
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAB28P51157 221 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AQP4P55087 323 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ERHP84090 104 aaKnown RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TFF3Q07654 80 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BNIP2Q12982 314 aa-2.92□□□□□ -2.88
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDO1Q16878 200 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM155Q4W5P6 130 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCNJQ5T5M9 372 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UTS2BQ765I0 119 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GKN2Q86XP6 184 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZFP82Q8N141 532 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MS4A15Q8N5U1 240 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM251Q8N6I4 163 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C12orf29Q8N999 325 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR10P1Q8NGE3 313 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AKR7LQ8NHP1 331 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMCR5Q8TEV8 140 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM162AQ96A26 154 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UBE2WQ96B02 151 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GALMQ96C23 342 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAB39BQ96DA2 213 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OXGR1Q96P68 337 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPR21Q99679 349 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCL19Q99731 98 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM62Q9BVG3 475 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TSPYL1Q9H0U9 437 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MFSD1Q9H3U5 465 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CST9LQ9H4G1 147 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NRCAMQ92823 1304 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DLC1Q96QB1 1528 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR52A4PA6NMU1 304 aa-2.93□□□□□ -2.88
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