RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 CHD8Q9HCK8 2581 aa15.87■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 C5orf49A4QMS7 147 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 CEBPGP53567 150 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 ICAM4Q14773 271 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 VWA1Q6PCB0 445 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 C5orf24Q7Z6I8 188 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 METTL9Q9H1A3 318 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 OR51B6Q9H340 312 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 DIRAS3O95661 229 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 RND2P52198 227 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 PCBD1P61457 104 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 TNFRSF9Q07011 255 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 FBXW9Q5XUX1 488 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 OR51T1Q8NGJ9 327 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 TMEM242Q9NWH2 141 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 WSB1Q9Y6I7 421 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 KALRNO60229 2985 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 ANGPTL7O43827 346 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 IGFBP7Q16270 282 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 TMEM183AQ8IXX5 376 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 RPRMLQ8N4K4 120 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 OR2G3Q8NGZ4 309 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 PECRQ9BY49 303 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 ESPL1Q14674 2120 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 SERPINE3A8MV23 424 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 CA11O75493 328 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 CELA3BP08861 270 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 RAB4AP20338 218 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 HLA-DRB3P79483 266 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 TMEM187Q14656 261 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 NRN1LQ496H8 165 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 BATF2Q8N1L9 274 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 OR1K1Q8NGR3 316 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 DKK4Q9UBT3 224 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 ARID1AO14497 2285 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 ST8SIA3O43173 380 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 LYZL6O75951 148 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 FAM87AP0C7U9 286 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 PGA5P0DJD9 388 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 PPA1Q15181 289 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 COLCA1Q6ZS62 124 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 LRTM2Q8N967 370 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 IGHV1-2P23083 117 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 TMPRSS3P57727 454 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 ZNF266Q14584 549 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 GUSBP1Q15486 140 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 POM121Q96HA1 1249 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 SNX22Q96L94 193 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 AK3Q9UIJ7 227 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX11-201ENST00000359238 C3orf80F5H4A9 247 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 EREGO14944 169 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 LILRA1O75019 489 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 ATP6V0CP27449 155 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 DUSP1P28562 367 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 HNF4GQ14541 408 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 ARL6IP1Q15041 203 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 C4orf17Q53FE4 359 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 RTL6Q6ICC9 239 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 SEM1Q6ZVN7 128 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 FAM214BQ7L5A3 538 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 OR10G4Q8NGN3 311 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 POM121L2Q96KW2 1035 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 NAA60Q9H7X0 242 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 GP6Q9HCN6 339 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 WNT5AP41221 380 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 FBXW12Q6X9E4 464 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 LYZL2Q7Z4W2 148 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 MDP1Q86V88 176 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 PP6455Q8WZ26 134 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 C18orf12Q96KH6 178 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 CDH20Q9HBT6 801 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 OR14J1Q9UGF5 321 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 HSF4Q9ULV5 492 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa15.82■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 CLDN34H7C241 214 aa15.82■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 CRYABP02511 175 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 AMBPP02760 352 aa15.82■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 PIGPP57054 158 aa15.82■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 FAM180AQ6UWF9 173 aa15.82■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SNX11-201ENST00000359238 BOD1Q96IK1 185 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms