RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 AADACP22760 399 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 ECI1P42126 302 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 FXYD4P59646 89 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA1AQ53H76 456 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUSP18Q8NEJ0 188 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52M1Q8NGK5 317 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCGB3A2Q96PL1 93 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 REG4Q9BYZ8 158 aa22.57■■□□□ 1.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM157AC9JC47 383 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF223E7ERA6 249 aa22.56■■□□□ 1.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHPT1Q8WUD6 406 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 LPAR2Q9HBW0 351 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 GFOD1Q9NXC2 390 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2W1Q9Y3N9 320 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa22.56■■□□□ 1.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DLX6P56179 175 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNMTQ14749 295 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 OXA1LQ15070 435 aa22.55■■□□□ 1.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPSQ8N2Z9 138 aa22.55■■□□□ 1.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf98A8MV24 154 aa22.54■■□□□ 1.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TUSC2O75896 110 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 LOXL3P58215 753 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR13C8Q8NGS7 320 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 EDARADDQ8WWZ3 215 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOMM40LQ969M1 308 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOB3AQ96BX8 217 aa22.54■■□□□ 1.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DOCK11Q5JSL3 2073 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 DSCAML1Q8TD84 2053 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 M0R1W7 72 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPNP16150 400 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARF6P62330 175 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 MORN2Q502X0 79 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 AADACL3Q5VUY0 350 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUDT15Q9NV35 164 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 SESN1Q9Y6P5 492 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMP23AO75900 390 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV1-8P0DP01 117 aa22.52■■□□□ 1.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KIR3DL3Q8N743 410 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARCH1Q8TCQ1 289 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOLLIPQ9H0E2 274 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 C20orf85Q9H1P6 137 aa22.52■■□□□ 1.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV6A0A075B6T7 132 aa22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 B4DSR2 109 aa22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 RLN1P04808 185 aa22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVFRD-1P60508 538 aa22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 LPCAT3Q6P1A2 487 aa22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC22Q8N966 263 aa22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2AK2Q8NG84 335 aa22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFAND1Q8TCF1 268 aa22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 SECTM1Q8WVN6 248 aa22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUCNR1Q9BXA5 334 aa22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A096LNT2 108 aa22.51■■□□□ 1.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC5A7Q9GZV3 580 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMP26Q9NRE1 261 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 KPTNQ9Y664 436 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSMD2Q7Z408 3487 aa22.5■■□□□ 1.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8U9P0C7N5 309 aa22.5■■□□□ 1.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL11BQ5VVY1 283 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8U1Q8NH10 309 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 FXYD6Q9H0Q3 95 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV3-7P01780 117 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 BAMBIQ13145 260 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC38A6Q8IZM9 456 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf42Q8N5U0 333 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 WFDC11Q8NEX6 87 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM216AQ8WUB2 273 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 LEAP2Q969E1 77 aa22.49■■□□□ 1.19
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