RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316786.1

C9orf106-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 106 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf106, Length 3,145 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106-201ENST00000316786 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 XRCC2O43543 280 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 GABRR1P24046 479 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 SPATA46Q5T0L3 261 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 CHST6Q9GZX3 395 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 MFNGO00587 321 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 OR2F2O95006 317 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 ARR3P36575 388 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 OR2F1Q13607 317 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM42Q69YG0 159 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 RNF150Q9ULK6 438 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 OR5H14A6NHG9 310 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF727A8MUV8 499 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 SERPINE3A8MV23 424 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 TPT1P13693 172 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 CEBPGP53567 150 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 IGFL3Q6UXB1 125 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 CALHM1Q8IU99 346 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 SPSB4Q96A44 273 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 SPSB1Q96BD6 273 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 TXN2Q99757 166 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 SLC6A7Q99884 636 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 PCNX1Q96RV3 2341 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf106-201ENST00000316786 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 TRDCB7Z8K6 153 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 FGF16O43320 207 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 LILRA1O75019 489 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 IGKV1D-12P01611 117 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 CHRM2P08172 466 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 MELTFP08582 738 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 VSIG10L2P0DP72 767 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 MC5RP33032 325 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 S100A10P60903 97 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 RPRMLQ8N4K4 120 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 DKK4Q9UBT3 224 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 SPTA1P02549 2419 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 HRH1P35367 487 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 PDCD1Q15116 288 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 IGFBP7Q16270 282 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 TAF9Q16594 264 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 Q6ZS92 163 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 C6orf201Q7Z4U5 140 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 GP6Q9HCN6 339 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF391Q9UJN7 358 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ARFRP1Q13795 201 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 SLC30A7Q8NEW0 376 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 DYRK2Q92630 601 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ESPL1Q14674 2120 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 UMAD1C9J7I0 102 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 GFRA3O60609 400 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 IFNA21P01568 189 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 CSTBP04080 98 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF735P0CB33 412 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 GLRA1P23415 457 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ID4P47928 161 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 BRICD5Q6PL45 260 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 CADP27708 2225 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 K7EPK0 472 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 RPS23P62266 143 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 GUSBP1Q15486 140 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 HAGHQ16775 308 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 PIGYQ3MUY2 71 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 Q6ZVH6 145 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 FRZBQ92765 325 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 ABHD17AQ96GS6 310 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf106-201ENST00000316786 CHD8Q9HCK8 2581 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms