RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641642.1

CASC19-247, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,107 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-247ENST00000641642 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 IFT46Q9NQC8 304 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 KPTNQ9Y664 436 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 TACC2O95359 2948 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 MED13LQ71F56 2210 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 A0A1W2PQ09 198 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 C17orf98A8MV24 154 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 J3QLI3 93 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 SSX5O60225 188 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 CSF1P09603 554 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 TAS2R46P59540 309 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 TAS2R19P59542 299 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 HLA-DRB3P79483 266 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 HMGN3Q15651 99 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 STEAP3Q658P3 488 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 TEX29Q8N6K0 151 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 BEST4Q8NFU0 473 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 OR4K15Q8NH41 348 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 OR52I2Q8NH67 350 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 GALMQ96C23 342 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 C19orf12Q9NSK7 152 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.059e-8■■■■□ 24.4
CASC19-247ENST00000641642 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 PDZD2O15018 2839 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 MEIOCA2RUB1 952 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 C22orf46C9J442 243 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 FAM157AC9JC47 383 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 C15orf65H3BRN8 121 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 F2RL2O00254 374 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 FABP7O15540 132 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 RGS11O94810 467 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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CASC19-247ENST00000641642 GLP1RP43220 463 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 NOTCH2Q04721 2471 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 PAX8Q06710 450 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 GLCCI1Q86VQ1 547 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 DTX3Q8N9I9 347 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 CCDC107Q8WV48 283 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ARL11Q969Q4 196 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 TMEM186Q96B77 213 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 GHITMQ9H3K2 345 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 CALYQ9NYX4 217 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 KLK11Q9UBX7 282 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 JPT1Q9UK76 154 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 CREBBPQ92793 2442 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 CR1P17927 2039 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 A0A087X0M5 115 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 A0A1B0GX30 115 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 C12orf77C9JDV5 145 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ITGB1BP1O14713 200 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 PTHLHP12272 177 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 PRTN3P24158 256 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ZBTB25P24278 435 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 FPR2P25090 351 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 GDNFP39905 211 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 INPP1P49441 399 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 DLX6P56179 175 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ARPC4P59998 168 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ERVFRD-1P60508 538 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 LCN2P80188 198 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 DGCR2P98153 550 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 DYRK1AQ13627 763 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 ZNF273Q14593 569 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 MEF2DQ14814 521 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-247ENST00000641642 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.49□□□□□ -1.05
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